More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1242 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1242  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1770  50S ribosomal protein L20  94.07 
 
 		 118 aa  226  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1736  50S ribosomal protein L20  94.07 
 
 		 118 aa  226  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000116439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 118 aa  185  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  74.36 
 
 		 118 aa  181  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  70.94 
 
 		 119 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  66.67 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1239  50S ribosomal protein L20  70.43 
 
 		 117 aa  160  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000443889  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  69.23 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  157  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  156  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 117 aa  156  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  61.54 
 
 		 117 aa  154  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 120 aa  153  8e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1382  50S ribosomal protein L20  67.65 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000098372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 117 aa  151  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1087  50S ribosomal protein L20  67.65 
 
 		 119 aa  150  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000484825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1407  50S ribosomal protein L20  69.81 
 
 		 118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.94552e-17  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  61.02 
 
 		 118 aa  150  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  62.39 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  59.32 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl190  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000102569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2031  50S ribosomal protein L20P  68.32 
 
 		 101 aa  145  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000296283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1441  50S ribosomal protein L20  64.35 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  58.47 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  56.41 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 115 aa  145  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  59.65 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  58.77 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf194  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00718228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  55.56 
 
 		 120 aa  144  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0203  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1840  50S ribosomal protein L20  57.63 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1278  50S ribosomal protein L20P  64.29 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0802935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  58.62 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>