27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1804 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  684    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  29.86 
 
 
246 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  23.81 
 
 
293 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  21.75 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
283 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  21.78 
 
 
327 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43937  predicted protein  23.63 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00956853  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  28.14 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  24.03 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  21.54 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3997  amidohydrolase 2  25 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169426  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  23.13 
 
 
272 aa  46.2  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  21.03 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  21.96 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  23.29 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  23.31 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  23.21 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  22.55 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  23.93 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  23.22 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  24.17 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>