41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0598 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0598  prophage LambdaSa1, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein  100 
 
 
1374 aa  2822    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1837  prophage LambdaSa2, lysin, putative  54.61 
 
 
468 aa  154  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00322069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  34.09 
 
 
481 aa  59.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  34.09 
 
 
478 aa  59.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  39.64 
 
 
712 aa  57.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  37.17 
 
 
643 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  37.61 
 
 
585 aa  55.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  36.11 
 
 
436 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  63.16 
 
 
344 aa  55.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  36.89 
 
 
813 aa  51.6  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  32.2 
 
 
706 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  51.02 
 
 
221 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  34.43 
 
 
587 aa  51.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  36.54 
 
 
283 aa  51.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  39.64 
 
 
512 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  56.1 
 
 
183 aa  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  36.11 
 
 
523 aa  50.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  33.06 
 
 
274 aa  49.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  34.84 
 
 
842 aa  49.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  32.74 
 
 
580 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.48 
 
 
689 aa  48.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  58.97 
 
 
403 aa  48.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  56.76 
 
 
400 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  38.53 
 
 
748 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1402  Collagen triple helix repeat protein  52.38 
 
 
190 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5441  Collagen triple helix repeat protein  56.76 
 
 
296 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  53.66 
 
 
322 aa  47.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  51.22 
 
 
158 aa  46.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.92 
 
 
1408 aa  46.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2584  phage minor structural protein  26.57 
 
 
1341 aa  46.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0192234  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  60.53 
 
 
2914 aa  46.2  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  38.89 
 
 
582 aa  46.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0248  hypothetical protein  56.76 
 
 
257 aa  45.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  32.08 
 
 
319 aa  45.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  52.63 
 
 
288 aa  45.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2593  phage minor structural protein  30.34 
 
 
855 aa  45.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2933  phage minor structural protein  29.03 
 
 
1496 aa  45.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0509957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  42.59 
 
 
435 aa  45.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  29.85 
 
 
300 aa  45.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  35.24 
 
 
253 aa  45.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  38.05 
 
 
1168 aa  45.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>