164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1111 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  39.53 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  37.78 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  43.02 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  43.02 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  43.02 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  37.65 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36.67 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  37.23 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  34.88 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  36.67 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  41.98 
 
 		 596 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  34.78 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  30.21 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 		 597 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  31.11 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  37.23 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  37.23 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  38.2 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  36.36 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  34.95 
 
 		 626 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  37.08 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  34.95 
 
 		 626 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  36.25 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  30.77 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  37.18 
 
 		 600 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  28.89 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  38.46 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  38.89 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  28.41 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  37.08 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  37.08 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.26 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  37.36 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  33.73 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 		 597 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  32.26 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  35.8 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  35.16 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  35.16 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  35.23 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  35.8 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  36.36 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  37.08 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  30.68 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  35.16 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  35.16 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 595 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  30.53 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  36.71 
 
 		 635 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1536  ferredoxin, 2Fe-2S  32.89 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  39.24 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  31.82 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  33.72 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0568  hypothetical protein  29.89 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  38.27 
 
 		 596 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  40.7 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  32.97 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1014  ferredoxin, 2fe-2s  33.78 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0974998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  29.55 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  29.55 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  26.14 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  38.27 
 
 		 626 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  30 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  30 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  31.71 
 
 		 575 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  35.96 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  34.07 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  29.41 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  33.7 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 		 572 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0736  ferredoxin, 2Fe-2S  33.77 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  25 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  34.09 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.95 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 		 640 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35 
 
 		 410 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  34.07 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1252  ferredoxin, 2Fe-2S  32.47 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000010791  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  34.07 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  34.07 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  35.16 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  27.47 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  31.46 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  34.07 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  34.07 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  35.16 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  35.16 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  35.16 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  23.86 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0661  NADH dehydrogenase (quinone)  31.18 
 
 		 623 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.435318  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0677  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.27 
 
 		 677 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  34.07 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  34.83 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  32.1 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.7 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>