More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1090 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1090  aspartate kinase  100 
 
 		 425 aa  790    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  43.5 
 
 		 467 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0843  aspartate kinase  40.12 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  30.61 
 
 		 472 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  42.81 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  41.18 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  37.03 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  40.07 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  38.44 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  39.24 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  38.92 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  42.53 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  39.59 
 
 		 823 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0142  aspartate kinase  39.2 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1980  aspartate kinase  33.43 
 
 		 469 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0255525  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  36.89 
 
 		 468 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  40.79 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1820  aspartate kinase  39.58 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000320312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0087  aspartate kinase  38.33 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0531987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  36.1 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3005  aspartate kinase  40.45 
 
 		 469 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2031  aspartate kinase  39.94 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1079  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.78 
 
 		 822 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.555098 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.07 
 
 		 819 aa  159  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.33 
 
 		 819 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  33.91 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.56 
 
 		 823 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  30.09 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1754  aspartate kinase  26.42 
 
 		 467 aa  153  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  40.77 
 
 		 834 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  33.03 
 
 		 541 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  32.97 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.65 
 
 		 822 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.26 
 
 		 822 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  36.97 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.05 
 
 		 822 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.35 
 
 		 822 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  30.27 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.05 
 
 		 822 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  30.7 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.44 
 
 		 821 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  38.91 
 
 		 819 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.56 
 
 		 822 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.26 
 
 		 822 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.26 
 
 		 822 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1127  aspartate kinase  36.86 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.892413  hitchhiker  0.00887106 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2542  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.05 
 
 		 815 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.573411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  33.89 
 
 		 818 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  32.34 
 
 		 814 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.95 
 
 		 822 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  31.66 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  37.76 
 
 		 835 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.39 
 
 		 835 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22113  bifunctional aspartokinase  36.39 
 
 		 870 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.35 
 
 		 817 aa  140  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1425  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  36.39 
 
 		 835 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.94 
 
 		 821 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  37.9 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.44 
 
 		 815 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1270  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.69 
 
 		 821 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.739227  hitchhiker  0.00698149 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  33.67 
 
 		 819 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0958  aspartate kinase  37.58 
 
 		 329 aa  136  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.584504  normal  0.0145055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  27.1 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  35.37 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  32.27 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.09 
 
 		 819 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.91 
 
 		 818 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2740  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.97 
 
 		 825 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1066  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.96 
 
 		 821 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  31.82 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  28.23 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.31 
 
 		 818 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0273  aspartate kinase  36.31 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.558883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1699  aspartate kinase  33.56 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.33468  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1840  aspartate kinase  37.78 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2556  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.9 
 
 		 819 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  29.21 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  29.85 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1494  aspartate kinase  27.69 
 
 		 804 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  33.71 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2330  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  39.16 
 
 		 822 aa  130  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0905  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.18 
 
 		 821 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.05 
 
 		 819 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  33.71 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  35.53 
 
 		 818 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  28.66 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3580  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.38 
 
 		 820 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.56 
 
 		 820 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  28.65 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  34.17 
 
 		 864 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1862  aspartate kinase  30.22 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1634  aspartate kinase I  27.65 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000370782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  29.06 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  28.38 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  30.31 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.98 
 
 		 819 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 		 819 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 		 819 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 		 819 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0142  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.74 
 
 		 820 aa  126  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000979597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>