22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2129 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  98.8 
 
 		 498 aa  925    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  82.13 
 
 		 498 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  937    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  43.46 
 
 		 491 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  41.3 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  38.93 
 
 		 493 aa  226  9e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  31.95 
 
 		 536 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  36.86 
 
 		 512 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  32.32 
 
 		 534 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  36.61 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  32.05 
 
 		 533 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  32.05 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  39.45 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  31.4 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  30.93 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  35.94 
 
 		 272 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  32.46 
 
 		 408 aa  47  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 268 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 296 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  29.05 
 
 		 258 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  34.69 
 
 		 876 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  26.05 
 
 		 264 aa  43.5  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>