More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0463 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  67 
 
 
504 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  99.61 
 
 
512 aa  992    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
512 aa  995    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  67.59 
 
 
513 aa  635    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  67.94 
 
 
500 aa  659    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  87.4 
 
 
509 aa  812    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  68.45 
 
 
510 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  57.39 
 
 
512 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  57.89 
 
 
512 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  58.23 
 
 
502 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  59.49 
 
 
502 aa  538  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  57.39 
 
 
512 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  58.05 
 
 
512 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  58.45 
 
 
502 aa  521  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  53.89 
 
 
510 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  57.12 
 
 
512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  57.5 
 
 
512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  54.47 
 
 
510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  55.04 
 
 
512 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  54.74 
 
 
516 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  55.58 
 
 
512 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  56.49 
 
 
510 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  53.85 
 
 
510 aa  498  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  53.65 
 
 
510 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  57.75 
 
 
510 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  54.15 
 
 
516 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  55.82 
 
 
510 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  49.31 
 
 
510 aa  494  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  56.37 
 
 
512 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  56.67 
 
 
512 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  53.89 
 
 
532 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  56.29 
 
 
512 aa  488  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  53.7 
 
 
510 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  60.12 
 
 
506 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  53.25 
 
 
510 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  54.49 
 
 
512 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  46.71 
 
 
502 aa  474  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  46.68 
 
 
506 aa  474  1e-132  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  55.81 
 
 
509 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.39 
 
 
500 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  54.08 
 
 
503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  49.01 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  51.82 
 
 
512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.23 
 
 
513 aa  434  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  47.53 
 
 
520 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  51.4 
 
 
499 aa  429  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  45.78 
 
 
509 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  46.64 
 
 
508 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  44.18 
 
 
512 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  45.19 
 
 
509 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  42.18 
 
 
511 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  43.45 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.09 
 
 
505 aa  415  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  41.96 
 
 
510 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  49.3 
 
 
504 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  41.95 
 
 
509 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  47.71 
 
 
513 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  42.46 
 
 
512 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  48.65 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  41.96 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  43.37 
 
 
508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  43.92 
 
 
516 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  40.95 
 
 
512 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  45.04 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  42.97 
 
 
513 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  47.76 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  46.43 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  41.5 
 
 
512 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  48.19 
 
 
501 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  45.54 
 
 
511 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  44.33 
 
 
509 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  44.33 
 
 
509 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  44.58 
 
 
510 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  40.86 
 
 
512 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  44.12 
 
 
513 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  44.44 
 
 
509 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  42.29 
 
 
513 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  42.26 
 
 
512 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  41.27 
 
 
512 aa  390  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  43.14 
 
 
518 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  43.6 
 
 
509 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  45.4 
 
 
498 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  44.82 
 
 
518 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  42.77 
 
 
514 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  46.51 
 
 
510 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  42.94 
 
 
507 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  46.2 
 
 
512 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  43.54 
 
 
509 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  46.12 
 
 
505 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  44.14 
 
 
509 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  46.84 
 
 
506 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  45.94 
 
 
507 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  47.27 
 
 
514 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  45.33 
 
 
509 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  50.5 
 
 
501 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  43.85 
 
 
511 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  44.66 
 
 
508 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  43.14 
 
 
509 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  41.45 
 
 
516 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  43.78 
 
 
507 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>