31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4316 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  73.41 
 
 		 282 aa  298  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  66.38 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  72.76 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  65.11 
 
 		 262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  72.48 
 
 		 339 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0369  protein of unknown function DUF81  66.81 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2602  protein of unknown function DUF81  62.4 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00334649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  42.75 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  44.4 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  44.4 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  72.95 
 
 		 662 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0671  hypothetical protein  66.67 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0981085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2721  hypothetical protein  39.24 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2678  hypothetical protein  44.33 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.330762  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  31.25 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  31.33 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  30.46 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  31.18 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  30 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  29.77 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  33 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  33.04 
 
 		 121 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  31.68 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  32.61 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  30.05 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  29.03 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  33.86 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  24.6 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  33.85 
 
 		 272 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>