38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3441 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  70.42 
 
 		 488 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  920    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  49.06 
 
 		 452 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  48.64 
 
 		 452 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  33.41 
 
 		 678 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  42.99 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  40.34 
 
 		 591 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  34.06 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  41.05 
 
 		 399 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  34.51 
 
 		 746 aa  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  38.03 
 
 		 278 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 1239 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  39.01 
 
 		 1182 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.63 
 
 		 418 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 		 673 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  39.2 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  33.88 
 
 		 294 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  28.45 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 1185 aa  90.5  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  33.18 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  28.88 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  27.47 
 
 		 222 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  30.62 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  29.22 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  28.76 
 
 		 222 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  31.54 
 
 		 1209 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  37.18 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  28.81 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  33.1 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  31.51 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 		 1991 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  35.48 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  25.71 
 
 		 769 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  27.65 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4120  hypothetical protein  29.37 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0502651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  28.77 
 
 		 258 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4333  hypothetical protein  33.04 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157774  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0175  hypothetical protein  27.78 
 
 		 269 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>