More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0855 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0855  asparagine synthase  100 
 
 
644 aa  1256    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.434854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1279  asparagine synthase  34.53 
 
 
642 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3028  asparagine synthase  34.86 
 
 
592 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  32.53 
 
 
653 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2340  asparagine synthase  23.81 
 
 
649 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.139025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3241  asparagine synthase  30.24 
 
 
649 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1351  asparagine synthase  31.16 
 
 
640 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1346  asparagine synthase  31.02 
 
 
639 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3386  asparagine synthase  24.58 
 
 
645 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.78 
 
 
654 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1460  asparagine synthase  33.94 
 
 
634 aa  170  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  25.72 
 
 
639 aa  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.41 
 
 
676 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1026  asparagine synthase  28.9 
 
 
617 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258049 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2826  asparagine synthase  29.48 
 
 
662 aa  124  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.28 
 
 
646 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2952  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.63 
 
 
609 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.101456  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.26 
 
 
666 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.34 
 
 
629 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.72 
 
 
664 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.13 
 
 
645 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.93 
 
 
603 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0125  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.65 
 
 
571 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  32.84 
 
 
636 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  28.18 
 
 
659 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.58 
 
 
646 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  25.08 
 
 
632 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2442  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.7 
 
 
607 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  24.76 
 
 
632 aa  104  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.92 
 
 
615 aa  104  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.46 
 
 
629 aa  104  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.37 
 
 
625 aa  103  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.16 
 
 
634 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.44 
 
 
882 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.18 
 
 
666 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.4 
 
 
627 aa  102  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.29 
 
 
621 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.78 
 
 
660 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.2 
 
 
667 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16588  hitchhiker  0.0019144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.44 
 
 
634 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3554  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.61 
 
 
640 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.37 
 
 
610 aa  100  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.18 
 
 
590 aa  98.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.14 
 
 
678 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.48 
 
 
660 aa  97.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.14 
 
 
678 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4419  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.61 
 
 
665 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.42 
 
 
635 aa  96.3  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.56 
 
 
624 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0524  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  18.62 
 
 
595 aa  96.3  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3428  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.47 
 
 
575 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.161683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.62 
 
 
592 aa  95.1  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.72 
 
 
637 aa  95.1  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1625  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  21.94 
 
 
607 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.462757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0355  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.74 
 
 
636 aa  93.2  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1751  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  21.94 
 
 
607 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00305862  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.18 
 
 
649 aa  93.2  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1577  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  22.6 
 
 
607 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.702633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0993  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.28 
 
 
617 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000224185  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.81 
 
 
607 aa  92.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1586  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  22.6 
 
 
607 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000166408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0764  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.86 
 
 
663 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181606 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.75 
 
 
647 aa  91.3  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1767  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  22.61 
 
 
607 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1828  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  21.85 
 
 
607 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.433581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1802  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.78 
 
 
322 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2121  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.64 
 
 
653 aa  90.5  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.973734  normal  0.744167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.47 
 
 
613 aa  90.5  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.76 
 
 
938 aa  89.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.83 
 
 
649 aa  89.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1882  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.95 
 
 
560 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.366504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5298  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.14 
 
 
629 aa  89.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.634266  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3317  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.84 
 
 
629 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1625  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.84 
 
 
607 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.786929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  25.72 
 
 
626 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.6 
 
 
625 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.73 
 
 
678 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  29.47 
 
 
590 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.65 
 
 
622 aa  89  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.32 
 
 
638 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0622  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.97 
 
 
630 aa  88.2  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0368004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.57 
 
 
632 aa  88.2  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4904  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.41 
 
 
613 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0220651  normal  0.122286 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0536  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.97 
 
 
662 aa  87.8  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1034  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.07 
 
 
614 aa  87.8  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1407  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.07 
 
 
607 aa  87.8  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.508738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1627  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.65 
 
 
615 aa  87.8  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  24 
 
 
630 aa  87.4  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1324  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  23.53 
 
 
622 aa  87  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3575  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  26.5 
 
 
607 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.16 
 
 
613 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.95 
 
 
655 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3068  asparagine synthase  33.19 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2683  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.09 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.890535  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  32.76 
 
 
626 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3261  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.63 
 
 
671 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1505  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.89 
 
 
615 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  34.89 
 
 
626 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2891  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.75 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3705  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.05 
 
 
647 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>