235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0044 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  100 
 
 		 83 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1242  phosphopantetheine-binding  50.72 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2147  phosphopantetheine-binding  45.12 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1220  phosphopantetheine-binding  37.8 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1037  phosphopantetheine-binding  40.96 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2776  Acyl carrier protein, AcpP  40.96 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  43.02 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1418  phosphopantetheine-binding  40.96 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.819274  normal  0.36565 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  45.16 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  43.55 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  43.55 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  48.21 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  48.21 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1224  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0192305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  47.46 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  44.16 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  41.94 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  48.21 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3488  hypothetical protein  35.71 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  37.35 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  39.74 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  43.86 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  45.76 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  47.46 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  43.84 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  45.76 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  35.9 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  30.49 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  30.86 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  45.61 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  44.07 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1587  acyl carrier protein  43.64 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  35.9 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  39.51 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  30.43 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1644  acyl carrier protein  43.64 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.28963  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1193  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  44.07 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_006686  CND04410  acyl carrier protein (acp), putative  46.3 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  44.07 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  44.07 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  46.43 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  33.75 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  44.07 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  30.43 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  42.37 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  31.52 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  42.37 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  31.52 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  35.9 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  34.62 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  35.9 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>