More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3439 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3439  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
326 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3093  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  95.71 
 
 
326 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.04 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0114  lipase/esterase, putative  44.55 
 
 
339 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.55 
 
 
339 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.88 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3173  acetyl esterase, putative  34.15 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3188  acetyl esterase, putative  33.54 
 
 
341 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.210653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3921  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.54 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.85 
 
 
324 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  29.23 
 
 
324 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.43 
 
 
347 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.43 
 
 
347 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  28.48 
 
 
349 aa  151  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  25.27 
 
 
303 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  27.63 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.8 
 
 
324 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.17 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.17 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.43 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  29.91 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  29.91 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  29.91 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  29.91 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  29.91 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  29.91 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3254  lipase  28.15 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0525665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.28 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0735  esterase  27.55 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1005  lipase  27.55 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.50865  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  30.64 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2556  carboxylesterase  27.34 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000242453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.76 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  29.44 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  28.97 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  29.21 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00427  acetyl esterase  27.27 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00432  hypothetical protein  27.27 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3787  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.62 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3140  acetyl esterase  27.27 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.848607  hitchhiker  0.00168444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0553  acetyl esterase  27.27 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1835  acetyl esterase  26.91 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3134  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.82 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.999028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0519  acetyl esterase  26.82 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0567  acetyl esterase  26.82 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.34 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2561  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.82 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  28.84 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0552  acetyl esterase  25.12 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.21 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.7 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.81 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  31.3 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0536  acetyl esterase  25.12 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0407  acetyl esterase  26.82 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2733  carboxylesterase  26.38 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0800200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1670  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.19 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.19 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.22 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.23 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0514  acetyl esterase  26.36 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.07 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.58 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.31 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.76 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  29.59 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0542  acetyl esterase  24.65 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0537  acetyl esterase  24.65 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.26 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.4 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  29.6 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.15 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.18 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1843  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.49 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0838402  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  26.99 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.4 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.14 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.29 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  24.64 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.48 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.22 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.7 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3667  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.78 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.7 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.27 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.43 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.13 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.22 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.13 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.58 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.2 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  32.8 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  28.19 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00390  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3312  putative lipase protein  37.86 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.12 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.56 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7998  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.23 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  30.33 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.06 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>