34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0690 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  87.52 
 
 		 506 aa  926    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  78.81 
 
 		 507 aa  817    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  76.34 
 
 		 507 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  85.35 
 
 		 507 aa  906    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  86.14 
 
 		 507 aa  913    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  76.74 
 
 		 507 aa  808    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  77.26 
 
 		 505 aa  820    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  76.98 
 
 		 504 aa  817    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  76.66 
 
 		 506 aa  813    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  76.56 
 
 		 515 aa  793    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  76.61 
 
 		 505 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1027    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  61.49 
 
 		 512 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  76.14 
 
 		 507 aa  795    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  76.23 
 
 		 505 aa  807    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  58.89 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  57.76 
 
 		 503 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  58.15 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  46.2 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  47.21 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  47.67 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  43.27 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  41.09 
 
 		 521 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  40.86 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  42.94 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  43.17 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  35.64 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  78.43 
 
 		 209 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  28.76 
 
 		 521 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  29.54 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  23.77 
 
 		 544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  18.91 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  19.37 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  19.37 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>