150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4411 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  75 
 
 		 145 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  74.26 
 
 		 136 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  79.41 
 
 		 136 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  71.85 
 
 		 135 aa  193  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  68.38 
 
 		 135 aa  187  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  65.93 
 
 		 135 aa  180  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  53.73 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  50.37 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  51.47 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  49.65 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  48.28 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  47.18 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.89 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  37.88 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.11 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.58 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4122  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.66 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.271092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1978  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.84 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  33.58 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1576  flagellar basal body rod protein FlgB  33.06 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.01 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.37 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  34.38 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.91 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.91 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0846  hypothetical protein  31.93 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.25 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  32.74 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  32.74 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.25 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  28.03 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2284  flagellar basal body rod protein FlgB  28.91 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  31.09 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.55 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  30.09 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  35.34 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  29.46 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16920  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.98 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.71 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  28.38 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  28.38 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0926  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.6 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3325  flagellar basal body rod protein FlgB  28.38 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  31.54 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  33.07 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  28.38 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  28.38 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0278  flagellar basal body rod protein FlgB  28.38 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3354  flagellar basal body rod protein FlgB  28.38 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  28.23 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3423  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.29 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1776  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.16 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  28.69 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2665  flagellar basal body rod protein FlgB  29.23 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.78 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  30.83 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.13 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  29.82 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  26.77 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0300  flagellar basal body rod protein FlgB  29.27 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2850  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  30.53 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4251  flagellar basal body rod protein FlgB  37.29 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  25 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  30.3 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1195  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.89 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  28.45 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.61 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4199  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.8 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000740  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.33 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1933  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.37 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1474  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.02 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.57 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.95 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  28.95 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1674  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.07 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.96 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.57 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  27.03 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3651  flagellar basal body rod protein FlgB  26.67 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0356  flagellar basal body rod protein FlgB  26.32 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3578  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.67 
 
 		 117 aa  44.3  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.32 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  29.2 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.93 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  31.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  31.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3952  flagellar basal body rod protein FlgB  33.9 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  31.71 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>