14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1661 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1661  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3800  hypothetical protein  81.94 
 
 
155 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4048  hypothetical protein  81.29 
 
 
155 aa  254  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551805  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2950  hypothetical protein  59.09 
 
 
151 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0765  hypothetical protein  53.38 
 
 
133 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0846  hypothetical protein  52.46 
 
 
133 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4643  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0094  hypothetical protein  47.97 
 
 
134 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2930  hypothetical protein  48.12 
 
 
136 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0682  hypothetical protein  44.72 
 
 
134 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0121  hypothetical protein  44.72 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1842  hypothetical protein  37.5 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1943  hypothetical protein  40.5 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3625  hypothetical protein  37.9 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.330686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>