114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1627 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  87.04 
 
 		 270 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  87.41 
 
 		 286 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  83.33 
 
 		 270 aa  474  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  83.7 
 
 		 270 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.96 
 
 		 270 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  81.48 
 
 		 270 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  85.66 
 
 		 258 aa  451  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  83.52 
 
 		 269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.08 
 
 		 279 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.08 
 
 		 279 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  44.62 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.37 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.37 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  44.11 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.23 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.44 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  47.23 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.7 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.54 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.58 
 
 		 271 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.38 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.76 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.31 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.31 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  41.31 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.76 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  39.25 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  38.6 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.77 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.34 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.77 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  27.57 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  32.04 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  21.9 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  22.01 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  28.5 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1902  uridylate kinase  30.84 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  27.62 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  28.03 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  26.92 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  28.57 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  28.57 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  28.57 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  28.57 
 
 		 235 aa  48.9  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  27.62 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  28.57 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  28.3 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  23.27 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  25.47 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  28.57 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  22.86 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  23.93 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  23.35 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  27.62 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  27.88 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  25.71 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  26.72 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  28.16 
 
 		 224 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  27.18 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  26.67 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  29.13 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  31.07 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  26.21 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  30.1 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  27.18 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  30.1 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  26.21 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  28.57 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  26.96 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  25.71 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  25 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  26.17 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  26.41 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  26.17 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  28.57 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  27.36 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  25.24 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  27.18 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  26.42 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  25.24 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  27.72 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  25.23 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  25.24 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  22.08 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  26.21 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  26.21 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  25.24 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  28.16 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  25.93 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  26.21 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4437  uridylate kinase  35.09 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>