12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2653 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  100 
 
 		 499 aa  976    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  67.14 
 
 		 497 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  38.41 
 
 		 1025 aa  209  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  45.19 
 
 		 502 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2378  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 700 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.868657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  26.16 
 
 		 474 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.01 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  29.18 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  25.51 
 
 		 504 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>