41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2378 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2378  O-antigen polymerase  100 
 
 
700 aa  1345    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.868657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  30.03 
 
 
497 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  27.22 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  31.28 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  30.04 
 
 
1025 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  27.66 
 
 
502 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4995  lipid A-core:surface polymer ligase  24.93 
 
 
402 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150422  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  30.34 
 
 
428 aa  55.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2022  O-antigen polymerase  29.94 
 
 
340 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3912  O-antigen ligase  23.05 
 
 
404 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0464096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  27.42 
 
 
443 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  23.88 
 
 
471 aa  51.2  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3931  O-antigen ligase  22.6 
 
 
404 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  26.86 
 
 
781 aa  50.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  30.29 
 
 
590 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.78 
 
 
457 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.78 
 
 
457 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4038  O-antigen ligase  22.6 
 
 
404 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  25.48 
 
 
436 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  23.97 
 
 
461 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  23.37 
 
 
532 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3993  O-antigen ligase  23.17 
 
 
404 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  27.85 
 
 
467 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  26.51 
 
 
438 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  24.82 
 
 
475 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4099  O-antigen ligase  22.86 
 
 
404 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.2 
 
 
436 aa  48.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  26.64 
 
 
500 aa  47.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  23.72 
 
 
446 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  18.68 
 
 
428 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  24.9 
 
 
594 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  28.83 
 
 
402 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  30.36 
 
 
415 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  30.86 
 
 
494 aa  45.8  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  26.37 
 
 
504 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  28.77 
 
 
400 aa  45.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  30.77 
 
 
459 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  33.33 
 
 
430 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  28.83 
 
 
607 aa  44.3  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  27.4 
 
 
431 aa  44.3  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  28.24 
 
 
422 aa  44.3  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>