29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1743 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1743  Cna B domain-containing protein  100 
 
 		 1384 aa  2773    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3541  hypothetical protein  70.43 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0304193  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.91 
 
 		 1641 aa  182  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.55 
 
 		 1641 aa  177  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2836  metallophosphoesterase  47 
 
 		 865 aa  159  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0383065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  26.28 
 
 		 848 aa  67.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  40.57 
 
 		 550 aa  56.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  27.06 
 
 		 635 aa  55.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  28.83 
 
 		 153 aa  55.1  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  29.38 
 
 		 409 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.32 
 
 		 3190 aa  52.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  28.96 
 
 		 520 aa  52  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  26.57 
 
 		 3393 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.38 
 
 		 458 aa  50.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  24.4 
 
 		 3242 aa  48.9  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  24.75 
 
 		 3392 aa  48.9  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.22 
 
 		 3486 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.68 
 
 		 3210 aa  48.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  26.49 
 
 		 1200 aa  47  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.96 
 
 		 416 aa  47  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.96 
 
 		 416 aa  47  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  25.6 
 
 		 3333 aa  47  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  26.58 
 
 		 882 aa  46.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  25.27 
 
 		 400 aa  45.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.99 
 
 		 400 aa  46.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  29.01 
 
 		 375 aa  45.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  25.89 
 
 		 735 aa  45.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  27.27 
 
 		 1092 aa  45.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  26.47 
 
 		 648 aa  45.1  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>