27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0675 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  88.56 
 
 		 826 bp  856    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4423    87.52 
 
 		 818 bp  801    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.227705  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4297    89.7 
 
 		 825 bp  827    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  87.99 
 
 		 826 bp  833    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  88.83 
 
 		 825 bp  894    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  89.22 
 
 		 826 bp  902    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  88.72 
 
 		 826 bp  870    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2629    86.06 
 
 		 823 bp  696    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  87.55 
 
 		 826 bp  775    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2051    87.1 
 
 		 827 bp  771    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  88.93 
 
 		 826 bp  880    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  88.48 
 
 		 826 bp  864    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1437    85.2 
 
 		 808 bp  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  85.87 
 
 		 814 bp  692    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0675    100 
 
 		 876 bp  1737    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  89.37 
 
 		 826 bp  914    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0694    90.55 
 
 		 395 bp  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1220    92.22 
 
 		 1955 bp  456  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000904356  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0891    83.48 
 
 		 807 bp  458  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000765218  unclonable  0.0000148237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4369    94.04 
 
 		 287 bp  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0407016  normal  0.373385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0895    88.22 
 
 		 366 bp  303  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000120526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1933    87.34 
 
 		 348 bp  224  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0890    90.74 
 
 		 159 bp  135  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.023767  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1425    93.33 
 
 		 159 bp  131  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0636    87.91 
 
 		 135 bp  93.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239894  normal  0.243236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4370    89.66 
 
 		 135 bp  67.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0256562  normal  0.563616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0102    85 
 
 		 244 bp  63.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000409194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>