52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0452 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  52.9 
 
 		 188 aa  169  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 196 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 216 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  35.95 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  38.56 
 
 		 339 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 192 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  47.06 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  50.63 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  49.3 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  47.95 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  38.96 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  32.93 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  32.86 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  32.53 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0994  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 429 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  32.86 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  32.93 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  32.93 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  32.93 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  32.93 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  32.93 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  32.86 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1011  hypothetical protein  33.71 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1083  hypothetical protein  33.71 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.263151  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  44.59 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1162  hypothetical protein  33.71 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4191  hypothetical protein  31.33 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0998  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1182  hypothetical protein  31.94 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0999  hypothetical protein  30.12 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1240  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  36.59 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  34.15 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  35.37 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4107  Protein of unknown function DUF2087  29.85 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1246  hypothetical protein  32.67 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.898285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  32.5 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4988  hypothetical protein  32.14 
 
 		 412 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43161  predicted protein  29.55 
 
 		 1601 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 		 120 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  36.84 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  36.84 
 
 		 94 aa  40.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>