More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3990 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3990  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497334  normal  0.07815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3671  GTP cyclohydrolase  84.81 
 
 		 247 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.773299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1830  GTP cyclohydrolase I  75.34 
 
 		 250 aa  359  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.043372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1301  GTP cyclohydrolase I  70.46 
 
 		 242 aa  349  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1074  GTP cyclohydrolase  74.09 
 
 		 243 aa  347  9e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4119  GTP cyclohydrolase I  71.04 
 
 		 243 aa  339  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5834  GTP cyclohydrolase I  68.67 
 
 		 243 aa  339  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0869  GTP cyclohydrolase  69.2 
 
 		 240 aa  335  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0912  GTP cyclohydrolase I  68.75 
 
 		 240 aa  334  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3631  GTP cyclohydrolase  67.67 
 
 		 267 aa  334  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1329  GTP cyclohydrolase I  68.78 
 
 		 267 aa  331  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104361  hitchhiker  0.00333374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0295  GTP cyclohydrolase I  65.91 
 
 		 262 aa  327  7e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0879  GTP cyclohydrolase  67.42 
 
 		 241 aa  327  8e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.133005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0808  GTP cyclohydrolase I  67.42 
 
 		 241 aa  327  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5449  GTP cyclohydrolase I  65.78 
 
 		 243 aa  325  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06001  putative GTP cyclohydrolase I  54.13 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0732  GTP cyclohydrolase  54.13 
 
 		 249 aa  261  4.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05621  putative GTP cyclohydrolase I  53.6 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05921  putative GTP cyclohydrolase I  53.15 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14731  GTP cyclohydrolase I  54.13 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0919672 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1027  GTP cyclohydrolase  54.13 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07841  putative GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.987944 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0536  GTP cyclohydrolase  53.15 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1631  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18971  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6263  GTP cyclohydrolase I  50.68 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3354  GTP cyclohydrolase  42.54 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  38.38 
 
 		 188 aa  135  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  40.11 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  39.56 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  35.45 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  35.14 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  39.89 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  36.17 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  40.34 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  39.68 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  41.88 
 
 		 188 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  37.08 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  39.89 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  37.43 
 
 		 227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  36.26 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  42.11 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  38.51 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  38.59 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  39.18 
 
 		 210 aa  124  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  38.25 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  39.23 
 
 		 187 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  39.01 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  36.61 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  38.95 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  35.33 
 
 		 189 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  39.89 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  39.36 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  36.96 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  34.62 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  36.56 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  39.89 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  37.63 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  40.43 
 
 		 200 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  36.41 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  37.36 
 
 		 187 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  37.19 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  36.81 
 
 		 186 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  35.45 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  37.3 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  35.9 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  37.36 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  37.36 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  37.97 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  37.57 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  35.48 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  36.56 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  34.88 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  34.95 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  32.61 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  38.59 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  37.7 
 
 		 188 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  35.56 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  40.64 
 
 		 212 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  35.23 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  34.52 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1665  GTP cyclohydrolase  37.21 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.109192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  36.93 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  35.14 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3643  GTP cyclohydrolase I  38.92 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0117786  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  34.07 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  37.91 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  32.09 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  36.26 
 
 		 206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  38.12 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  35.16 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  38.02 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  38.18 
 
 		 188 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2829  GTP cyclohydrolase I  39.13 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0351357  normal  0.452296 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  38.59 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  35.2 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  36.51 
 
 		 213 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>