74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3826 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  100 
 
 		 662 aa  1361    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  63.96 
 
 		 651 aa  833    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  62.18 
 
 		 678 aa  808    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  68.23 
 
 		 653 aa  894    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  68.43 
 
 		 653 aa  895    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  68.48 
 
 		 678 aa  930    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  67.98 
 
 		 653 aa  891    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  68.13 
 
 		 653 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  68.28 
 
 		 652 aa  920    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  68.43 
 
 		 653 aa  895    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  59.14 
 
 		 688 aa  743    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  65.43 
 
 		 631 aa  859    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  61.8 
 
 		 650 aa  819    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  68.48 
 
 		 678 aa  930    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  68.45 
 
 		 650 aa  904    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  68.08 
 
 		 653 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  57.47 
 
 		 648 aa  716    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  69.64 
 
 		 653 aa  911    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  68.73 
 
 		 654 aa  932    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  68.78 
 
 		 654 aa  936    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  68.13 
 
 		 653 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  68.73 
 
 		 651 aa  936    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  64.59 
 
 		 673 aa  837    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  68.8 
 
 		 650 aa  912    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  68.43 
 
 		 653 aa  895    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  68.02 
 
 		 630 aa  889    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  43.44 
 
 		 623 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  35.81 
 
 		 583 aa  324  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7168  putative exported alkaline phosphatase  64.05 
 
 		 253 aa  294  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  35.71 
 
 		 630 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  32.5 
 
 		 607 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  36.62 
 
 		 625 aa  243  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  27.25 
 
 		 626 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  28.57 
 
 		 624 aa  127  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  28.3 
 
 		 612 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  27.83 
 
 		 631 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  26.92 
 
 		 883 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  26.92 
 
 		 884 aa  77.8  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  25 
 
 		 887 aa  61.6  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  24.4 
 
 		 698 aa  60.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  26.42 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  25.12 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  21.04 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  25.45 
 
 		 738 aa  57  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  24.83 
 
 		 680 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  26.14 
 
 		 587 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  22.88 
 
 		 681 aa  55.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  31.88 
 
 		 739 aa  54.3  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  25 
 
 		 715 aa  53.9  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  27.68 
 
 		 458 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  22.62 
 
 		 672 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  24.6 
 
 		 669 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  23.16 
 
 		 667 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  23.15 
 
 		 726 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  27.12 
 
 		 593 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  23.11 
 
 		 672 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  27.12 
 
 		 593 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  23.99 
 
 		 638 aa  51.2  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4202  protein of unknown function DUF839  21.9 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  23.71 
 
 		 704 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  22.84 
 
 		 662 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  24.41 
 
 		 693 aa  47.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  28.05 
 
 		 694 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 596 aa  47  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  23.15 
 
 		 702 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  27.17 
 
 		 786 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2679  protein of unknown function DUF839  32.26 
 
 		 493 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  27.9 
 
 		 689 aa  45.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  28.68 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 560 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  28.25 
 
 		 629 aa  44.3  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  23.32 
 
 		 663 aa  43.9  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  24.61 
 
 		 689 aa  43.9  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>