40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2839 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0481  Relaxase/mobilization nuclease family protein  47.18 
 
 		 807 aa  184  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0361  Relaxase/mobilization nuclease family protein  47.69 
 
 		 804 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1709  Relaxase/mobilization nuclease family protein  33.65 
 
 		 438 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2897  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.85 
 
 		 402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0597444  normal  0.476634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2943  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.82 
 
 		 386 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1610  Relaxase/mobilization nuclease family protein  36.6 
 
 		 444 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2918  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  32.12 
 
 		 404 aa  104  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.14 
 
 		 392 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32.14 
 
 		 392 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2898  relaxase/mobilization nuclease domain protein  30.57 
 
 		 413 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000982832 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.87 
 
 		 279 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  32 
 
 		 306 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6240  Relaxase/mobilization nuclease family protein  34.15 
 
 		 514 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0321  hypothetical protein  36.59 
 
 		 510 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.54 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4335  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.68 
 
 		 519 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.43 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0868  mobilization protein  30.66 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.024127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4164  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.59 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257908  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0180  hypothetical protein  30.94 
 
 		 484 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0133176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5231  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.89 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7038  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.51 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.03 
 
 		 464 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4225  relaxase/mobilization nuclease family protein  29.81 
 
 		 538 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3713  relaxase/mobilization nuclease family protein  21.29 
 
 		 431 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2355  relaxase/mobilization nuclease  33.55 
 
 		 479 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149607  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4407  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.86 
 
 		 546 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  31.17 
 
 		 443 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1489  hypothetical protein  24.53 
 
 		 426 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4629  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.17 
 
 		 545 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7019  Relaxase/mobilization nuclease family protein  26.92 
 
 		 294 aa  48.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3018  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.7 
 
 		 426 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  27.27 
 
 		 398 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  28.79 
 
 		 650 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  28.79 
 
 		 651 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  34.38 
 
 		 805 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  23.88 
 
 		 752 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4934  relaxase/mobilization nuclease family protein  33.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421912  normal  0.821482 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  25.81 
 
 		 830 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>