More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2729 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  54.88 
 
 		 314 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  51.58 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  49.31 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  52.9 
 
 		 307 aa  268  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.08 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  42.41 
 
 		 361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  42.5 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  46.43 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  36.74 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  29.8 
 
 		 652 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.34 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  38.01 
 
 		 691 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  28.81 
 
 		 358 aa  109  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 		 691 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 		 691 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  34.25 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  25.78 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 705 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 355 aa  99.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  29.22 
 
 		 336 aa  99.4  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 683 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  30.58 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 714 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 703 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2722  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 369 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0854  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0405  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 624 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  31.19 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.34 
 
 		 276 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  30.34 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  30.34 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  25.82 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1480  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  31.31 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  30.34 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>