65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1109 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  63.93 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  34.17 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  36.67 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  35.83 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  31.67 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  31.67 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  30.83 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  30.83 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  30 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  30 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  30 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  30.83 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  30.83 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  31.67 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  30.83 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  29.6 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1248  hypothetical protein  27.87 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0238294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  30.7 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  30.7 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2630  hypothetical protein  25 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.640654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  29.37 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  29.37 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  25.62 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4166  hypothetical protein  27.68 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.25145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3783  hypothetical protein  26.79 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  29.2 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  24.79 
 
 		 285 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  28.95 
 
 		 119 aa  50.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  31.43 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  28.16 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  29.13 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  28.16 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2480  hypothetical protein  31.37 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3591  hypothetical protein  27.03 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0513  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.819192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3978  hypothetical protein  27.03 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3518  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0513  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  26.36 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  26.36 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0472  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.088779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3796  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  32.99 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3852  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3346  hypothetical protein  26.13 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  28.16 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0514  hypothetical protein  26.13 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  29.9 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  29.9 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2442  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  30.93 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3192  hypothetical protein  28.18 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  30.17 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  28.81 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3283  hypothetical protein  24.32 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  29.7 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  28.87 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  28.87 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  28.87 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  29.9 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4086  hypothetical protein  23.68 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  22.73 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3361  hypothetical protein  22.32 
 
 		 127 aa  40  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0746903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>