22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0324 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0324  hypothetical protein  100 
 
 		 667 aa  1362    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.669728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0517  integrase family protein  26.66 
 
 		 689 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2291  hypothetical protein  26.39 
 
 		 671 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.031197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3232  integrase family protein  26.76 
 
 		 681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1124  hypothetical protein  22.56 
 
 		 655 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0330  putative integrase  23.51 
 
 		 676 aa  107  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1600  DNA-binding protein  23.11 
 
 		 561 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4985  hypothetical protein  26.7 
 
 		 774 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5178  hypothetical protein  26.98 
 
 		 774 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0309  hypothetical protein  27.27 
 
 		 898 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01691  hypothetical protein  28.02 
 
 		 767 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1845  hypothetical protein  28.02 
 
 		 767 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0483033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3891  conserved DNA-binding protein  18.96 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2900  DNA-binding protein  19.83 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26871  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4605  hypothetical protein  28.32 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.468839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1699  hypothetical protein  19.16 
 
 		 539 aa  57  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0584  hypothetical protein  21.95 
 
 		 693 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.286852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0559  hypothetical protein  21.95 
 
 		 693 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0590  hypothetical protein  21.95 
 
 		 693 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2949  hypothetical protein  22.71 
 
 		 552 aa  53.9  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.327951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0086  hypothetical protein  25.23 
 
 		 779 aa  50.8  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4013  hypothetical protein  25 
 
 		 751 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>