More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1031 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  69.37 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  68.18 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  66.37 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1295  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.816145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  68.47 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  68.18 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  68.18 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  68.18 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 116 aa  148  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  65.45 
 
 		 113 aa  147  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  66.36 
 
 		 113 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 114 aa  146  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  67.59 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  67.29 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  66.36 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  66.36 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  63.39 
 
 		 114 aa  144  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  67.29 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  65.45 
 
 		 114 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 116 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  67.29 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1018  50S ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00624649  normal  0.659291 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 116 aa  143  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  143  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  67.29 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  63.16 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  67.86 
 
 		 114 aa  141  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  65.42 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  60.18 
 
 		 114 aa  140  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1489  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1521  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.309648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1395  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.021497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 119 aa  139  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  61.47 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  61.47 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0698  ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000127437  hitchhiker  0.00000355367 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  60.91 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 116 aa  137  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 115 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  66.99 
 
 		 115 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  63.55 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>