More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0199 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  100 
 
 
324 aa  655    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  57.63 
 
 
326 aa  353  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.76 
 
 
325 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  47.77 
 
 
325 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
305 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  46.15 
 
 
304 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  43.48 
 
 
323 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  45.06 
 
 
305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  45.73 
 
 
305 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  43.83 
 
 
305 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  45.06 
 
 
305 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.03 
 
 
304 aa  264  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  47.59 
 
 
311 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  45.35 
 
 
311 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  46.48 
 
 
310 aa  259  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  43.65 
 
 
308 aa  259  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  44.74 
 
 
301 aa  258  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  42.9 
 
 
303 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
305 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  47.12 
 
 
330 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  46.98 
 
 
313 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  40.3 
 
 
320 aa  242  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
309 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
317 aa  224  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  37.81 
 
 
298 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  44.08 
 
 
309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  42.01 
 
 
305 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  35.14 
 
 
348 aa  211  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.36 
 
 
300 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.36 
 
 
300 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
299 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.36 
 
 
300 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.36 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.36 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.36 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.36 
 
 
300 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.99 
 
 
300 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.85 
 
 
300 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  35.74 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  38.27 
 
 
319 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  38.63 
 
 
296 aa  192  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  36.18 
 
 
296 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  39.86 
 
 
302 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  36.51 
 
 
296 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  37.41 
 
 
296 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  41.13 
 
 
298 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  35.86 
 
 
296 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.01 
 
 
298 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
298 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  35.86 
 
 
296 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.01 
 
 
298 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
296 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  35.71 
 
 
298 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  35.53 
 
 
296 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
291 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  34.49 
 
 
293 aa  185  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  40.26 
 
 
295 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  39.02 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  37.68 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  39.02 
 
 
298 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  39.02 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  38.68 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  39.72 
 
 
298 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  39.72 
 
 
298 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  39.72 
 
 
298 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  39.72 
 
 
298 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  39.72 
 
 
298 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  39.72 
 
 
298 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  38.68 
 
 
298 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  39.72 
 
 
298 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  38.68 
 
 
298 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  35.39 
 
 
302 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  35.39 
 
 
302 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  37.72 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  40.83 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.34 
 
 
296 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  35.69 
 
 
297 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  40 
 
 
304 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  35.84 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.44 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.28 
 
 
307 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  35.8 
 
 
302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  35.71 
 
 
304 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  39.73 
 
 
347 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  37.19 
 
 
296 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  35.17 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  32.63 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  34.29 
 
 
330 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  35.92 
 
 
326 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
325 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  34.35 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  34.35 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.35 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  34.35 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>