62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2919 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6278  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  89.49 
 
 		 429 aa  774    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2658  putative spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  97.45 
 
 		 432 aa  840    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.915036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2919  putative spermidine/putrescine ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 432 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3636  hypothetical protein  67.86 
 
 		 421 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4063  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic binding protein  69.11 
 
 		 421 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.797968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3337  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic binding protein  68.86 
 
 		 421 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.874781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3269  twin-arginine translocation pathway signal  61.43 
 
 		 429 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1010  twin-arginine translocation pathway signal  60.75 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617003  hitchhiker  0.00435801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0101  ABC transporter substrate-binding protein  60.89 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0635162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3534  twin-arginine translocation pathway signal  62.47 
 
 		 422 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5902  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  58.67 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4739  ABC transporter substrate-binding protein  61.45 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3943  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  60.71 
 
 		 420 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.627454  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1361  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  58.77 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.721333  normal  0.0486797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5257  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  58.29 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3374  ABC transporter substrate-binding protein  59.43 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0208  twin-arginine translocation pathway signal  60.96 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0825185 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2472  twin-arginine translocation pathway signal  60.57 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2893  putative ABC transporter substrate-binding protein  56.88 
 
 		 429 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1905  putative ABC transporter substrate-binding protein  51.54 
 
 		 421 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7129  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  50.7 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1216  signal peptide prediction  38.25 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3931  hypothetical protein  38.56 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1002  hypothetical protein  36.9 
 
 		 412 aa  292  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4197  hypothetical protein  37.79 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3722  signal peptide prediction  35.02 
 
 		 435 aa  279  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5885  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  37.72 
 
 		 405 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2912  signal peptide prediction  35.61 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.511961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2087  hypothetical protein  36.62 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0716956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01580  signal peptide prediction  36.76 
 
 		 427 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5880  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  33.02 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0997  putative substrate-binding component of ABC transporter  33.42 
 
 		 406 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1052  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  33.71 
 
 		 389 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5836  ABC transporter substrate binding protein (spermidine/putrescine)  29.45 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0815  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.93 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2141  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.93 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 351 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  23.56 
 
 		 345 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4502  ABC polyamine transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.13 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4308  extracellular solute-binding protein  20.39 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00256094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 355 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2854  putative spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  26.99 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404932  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2605  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 396 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2611  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 396 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.768707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2566  twin-arginine translocation pathway signal  26.94 
 
 		 396 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3955  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  22.55 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1551  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3241  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 341 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.047914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0281  putative polyamine-binding lipoprotein  26.32 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.565719  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  20.73 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  24.9 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0022  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.68503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3137  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.713269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1581  putative ABC transport system, exported substrate-binding protein  21.75 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3377  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0539  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 358 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.11 
 
 		 369 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0086  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein, putative  23 
 
 		 343 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>