244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2371 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1306  cobaltochelatase subunit CobN  68.35 
 
 
1263 aa  1534    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1170  cobaltochelatase  46.57 
 
 
1220 aa  902    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.345597  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1576  cobaltochelatase subunit CobN  48.11 
 
 
1270 aa  976    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104948  normal  0.435931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1059  cobaltochelatase, CobN subunit  38.49 
 
 
1435 aa  743    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2099  cobaltochelatase subunit CobN  46.32 
 
 
1281 aa  923    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4806  cobaltochelatase subunit CobN  47.65 
 
 
1269 aa  970    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140016  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1377  cobaltochelatase, CobN subunit  46.63 
 
 
1293 aa  974    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.376222  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5367  cobaltochelatase, CobN subunit  39.4 
 
 
1426 aa  733    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0562  cobaltochelatase subunit CobN  43.33 
 
 
1290 aa  1065    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0158  cobaltochelatase  66.4 
 
 
1235 aa  659    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75394  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3366  cobaltochelatase subunit CobN  62.43 
 
 
1240 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2407  cobaltochelatase subunit CobN  47.01 
 
 
1278 aa  951    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1518  cobaltochelatase subunit CobN  36.63 
 
 
1364 aa  715    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0461692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0738  cobaltochelatase subunit CobN  51.4 
 
 
1286 aa  1040    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5001  cobaltochelatase subunit CobN  47.52 
 
 
1269 aa  1011    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0676394  decreased coverage  0.00000811844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6126  cobaltochelatase subunit CobN  42.78 
 
 
1238 aa  782    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173021  hitchhiker  0.00419275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2131  cobaltochelatase subunit CobN  82.45 
 
 
1330 aa  2191    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0808058  normal  0.0966772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2647  cobaltochelatase CobN subunit  70.62 
 
 
1260 aa  1562    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.844431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0883  cobaltochelatase subunit CobN  46.57 
 
 
1220 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1582  cobaltochelatase subunit CobN  48.92 
 
 
1269 aa  1008    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0866134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1177  cobaltochelatase subunit CobN  47.97 
 
 
1269 aa  975    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0635  cobaltochelatase subunit CobN  41.33 
 
 
1237 aa  775    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0132  cobaltochelatase subunit CobN  44.76 
 
 
1363 aa  961    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.305949  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1557  cobaltochelatase subunit CobN  48.2 
 
 
1270 aa  975    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1657  cobaltochelatase subunit CobN  47.97 
 
 
1269 aa  975    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1631  cobaltochelatase subunit CobN  47.79 
 
 
1269 aa  972    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498133  normal  0.0450481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1291  cobaltochelatase, CobN subunit  41.33 
 
 
1264 aa  752    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.526885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1759  cobaltochelatase subunit CobN  68.29 
 
 
1273 aa  1818    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193122  normal  0.0775991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2371  cobaltochelatase subunit CobN  100 
 
 
1388 aa  2786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408289  normal  0.0205166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1877  cobaltochelatase subunit CobN  66.52 
 
 
1263 aa  1526    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0787  cobaltochelatase subunit CobN  51.31 
 
 
1249 aa  1037    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1615  cobaltochelatase subunit CobN  46.48 
 
 
1220 aa  900    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2710  cobaltochelatase subunit CobN  40.23 
 
 
1222 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.381245  decreased coverage  0.0000125335 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10041  cobalamin biosynthetic protein CobN  37.52 
 
 
1262 aa  746    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.460676 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0277  cobaltochelatase subunit CobN  46.57 
 
 
1220 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.408292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3301  cobaltochelatase, CobN subunit  45.32 
 
 
1247 aa  965    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1269  cobaltochelatase subunit CobN  68.35 
 
 
1263 aa  1535    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1938  cobaltochelatase subunit CobN  46.32 
 
 
1281 aa  922    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.812521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1954  cobaltochelatase subunit CobN  46.23 
 
 
1281 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1279  Cobaltochelatase  33.95 
 
 
1258 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0636  cobaltochelatase subunit CobN  62.1 
 
 
1247 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411028  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1167  cobaltochelatase subunit CobN  42.11 
 
 
1288 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2269  cobaltochelatase subunit CobN  42.87 
 
 
1253 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2422  cobaltochelatase subunit CobN  42.64 
 
 
1253 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.842189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2773  cobaltochelatase subunit CobN  42.17 
 
 
1253 aa  592  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3015  cobaltochelatase subunit CobN  55.38 
 
 
1254 aa  562  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5746  cobaltochelatase, CobN subunit  56.15 
 
 
1273 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3507  cobaltochelatase subunit CobN  56.28 
 
 
1253 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3149  cobN/magnesium chelatase family protein  55.17 
 
 
1254 aa  559  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3098  cobaltochelatase subunit CobN  54.86 
 
 
1257 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.391048  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4586  cobaltochelatase subunit CobN  53.12 
 
 
1248 aa  558  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465963  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1646  cobaltochelatase subunit CobN  53.15 
 
 
1267 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244329  normal  0.0408694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3152  cobaltochelatase subunit CobN  55.51 
 
 
1267 aa  559  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456868  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25970  cobaltochelatase subunit CobN  56.21 
 
 
1248 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.359324  normal  0.429696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2219  cobaltochelatase subunit CobN  56.42 
 
 
1248 aa  552  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4488  cobaltochelatase, CobN subunit  52.54 
 
 
1253 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.036895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0097  cobaltochelatase subunit CobN  47.77 
 
 
1263 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1771  cobaltochelatase subunit CobN  30.91 
 
 
1343 aa  509  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5234  cobaltochelatase, CobN subunit  52.92 
 
 
1261 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2815  cobaltochelatase, CobN subunit  53.91 
 
 
1247 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.265823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2900  cobaltochelatase, CobN subunit  54.31 
 
 
1348 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241164  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0126  cobaltochelatase  29.02 
 
 
1291 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.48483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2528  cobaltochelatase subunit CobN  49.59 
 
 
1222 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.341314  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4862  cobaltochelatase subunit CobN  53.23 
 
 
1266 aa  449  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114113  normal  0.358132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0648  cobaltochelatase, CobN subunit  47.66 
 
 
1409 aa  436  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1357  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  46.48 
 
 
1242 aa  435  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.250832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3224  magnesium chelatase subunit H  28.37 
 
 
1329 aa  429  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.335688  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1784  cobaltochelatase subunit CobN  52.17 
 
 
1193 aa  426  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.174802  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1828  magnesium chelatase subunit H  29.56 
 
 
1341 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0558  cobaltochelatase, CobN subunit  51.85 
 
 
1453 aa  426  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1278  cobaltochelatase, CobN subunit  47.35 
 
 
1406 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3426  cobaltochelatase subunit CobN  51.69 
 
 
1205 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127026  normal  0.438589 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14911  cobalamin biosynthetic protein CobN  49.08 
 
 
1259 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.629118 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0626  cobalamin biosynthesis protein  50.35 
 
 
1379 aa  423  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.941257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5591  Cobaltochelatase  52.45 
 
 
1207 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.270637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1121  cobaltochelatase, CobN subunit  48.71 
 
 
1256 aa  422  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2533  cobaltochelatase subunit CobN  51.69 
 
 
1198 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10391  magnesium chelatase subunit H  28.53 
 
 
1336 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2496  cobaltochelatase subunit CobN  51.69 
 
 
1198 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2541  cobaltochelatase subunit CobN  51.69 
 
 
1198 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2196  cobaltochelatase, CobN subunit  51.29 
 
 
1191 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0587089  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  44.32 
 
 
1262 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0827  magnesium chelatase subunit H  28.79 
 
 
1336 aa  420  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09361  magnesium chelatase subunit H  28.82 
 
 
1339 aa  419  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4981  magnesium chelatase subunit H  28.95 
 
 
1330 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08851  cobalamin biosynthetic protein CobN  41.51 
 
 
1253 aa  419  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327208 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2352  cobaltochelatase, CobN subunit  51.17 
 
 
1444 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3112  cobaltochelatase subunit CobN  48.33 
 
 
1213 aa  416  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0583  cobaltochelatase, CobN subunit  50.12 
 
 
1206 aa  415  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.773066  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09611  cobalamin biosynthetic protein CobN  47.12 
 
 
1245 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1974  magnesium chelatase subunit H  29.64 
 
 
1277 aa  413  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.44138  normal  0.650395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12098  cobaltochelatase subunit CobN  50.72 
 
 
1194 aa  412  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000146421  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13931  magnesium chelatase subunit H  29.07 
 
 
1347 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0983258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4320  magnesium chelatase subunit H  28.78 
 
 
1330 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4382  magnesium chelatase subunit H  28.78 
 
 
1330 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0354269  unclonable  0.0000000162582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17590  cobaltochelatase subunit CobN  50 
 
 
1199 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0145  cobaltochelatase subunit CobN  49.65 
 
 
1212 aa  407  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09801  cobalamin biosynthetic protein CobN  45.24 
 
 
1245 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09821  cobalamin biosynthetic protein CobN  46.54 
 
 
1245 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13265  protoporphyrin IX magnesium chelatase, subunit H  28.36 
 
 
1343 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>