32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2073 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  86.34 
 
 
227 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  64.68 
 
 
232 aa  268  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0836  hypothetical protein  43.58 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.206706 
 
 
-
 
NC_002936  DET0581  hypothetical protein  39.37 
 
 
240 aa  161  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0555  DNA alkylation repair enzyme-like protein  36.89 
 
 
240 aa  158  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4304  hypothetical protein  41.07 
 
 
218 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.648821  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_520  hypothetical protein  37.33 
 
 
240 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1298  hypothetical protein  38.97 
 
 
235 aa  144  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  39.09 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2734  hypothetical protein  26.04 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000970803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2941  hypothetical protein  23.98 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000572479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2940  hypothetical protein  23.98 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6684100000000001e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2732  hypothetical protein  23.98 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2660  hypothetical protein  24.37 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2946  hypothetical protein  23.98 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2683  hypothetical protein  23.98 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000553491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2299  hypothetical protein  23.47 
 
 
227 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0222691  hitchhiker  5.32762e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2978  hypothetical protein  23.35 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000992399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2986  hypothetical protein  22.84 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000288545  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  28.35 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  27.59 
 
 
243 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  29.94 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  30.15 
 
 
236 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  26.88 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0294  protein of unknown function DUF1061  28.24 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  24.38 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  28.92 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  26.51 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  29.95 
 
 
243 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  25.24 
 
 
238 aa  42  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>