More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2818 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  59.33 
 
 		 538 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  59.81 
 
 		 538 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 536 aa  1093    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  58.33 
 
 		 538 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  57.78 
 
 		 538 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  57.96 
 
 		 538 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  53.43 
 
 		 551 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  53.35 
 
 		 539 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  53.16 
 
 		 539 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  53.54 
 
 		 536 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  52.5 
 
 		 538 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  52.68 
 
 		 538 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  52.51 
 
 		 538 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  52.7 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  52.31 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  51.96 
 
 		 537 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  51.58 
 
 		 538 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  52.22 
 
 		 539 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  51.02 
 
 		 540 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  50.83 
 
 		 540 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  51.39 
 
 		 540 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  56.07 
 
 		 538 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  48.99 
 
 		 535 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  47.79 
 
 		 535 aa  521  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  48.15 
 
 		 554 aa  523  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  47.87 
 
 		 537 aa  521  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  51.29 
 
 		 534 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  47.7 
 
 		 546 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  47.51 
 
 		 535 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  47.79 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  48.99 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  49.45 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  48.99 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  50.46 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  47.23 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  47.23 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  47.23 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  47.23 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  47.05 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  47.22 
 
 		 536 aa  511  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  46.68 
 
 		 535 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  47.05 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  47.23 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  47.42 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  47.05 
 
 		 535 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  47.33 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  47.04 
 
 		 536 aa  509  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  47.22 
 
 		 536 aa  510  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  48.52 
 
 		 534 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  47.6 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  47.05 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.62 
 
 		 537 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  47.23 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  47.05 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  47.23 
 
 		 535 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  47.05 
 
 		 535 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  47.33 
 
 		 535 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  47.33 
 
 		 535 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  49.17 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.88 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.18 
 
 		 542 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  47.05 
 
 		 535 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  48.81 
 
 		 535 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  47.62 
 
 		 535 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  47.07 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  46.51 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  48.35 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  47.89 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1527  propionyl-CoA carboxylase  48.9 
 
 		 557 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  47.16 
 
 		 535 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  48.79 
 
 		 534 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 		 553 aa  503  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  48.9 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  46.79 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  48.81 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1890  propionyl-CoA carboxylase  48.53 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  47.43 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.26 
 
 		 529 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  49.08 
 
 		 535 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  47.79 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  47.8 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  47.8 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  48.42 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  47.8 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1532  propionyl-CoA carboxylase  48.8 
 
 		 532 aa  495  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  48.62 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  47.07 
 
 		 535 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  47.09 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  46.96 
 
 		 540 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  47.62 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2808  Propionyl-CoA carboxylase  48.79 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2934  propionyl-CoA carboxylase  47.87 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.126477  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1643  propionyl-CoA carboxylase  48.35 
 
 		 537 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  47.81 
 
 		 534 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  48.87 
 
 		 542 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  48.95 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  47.44 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3433  Propionyl-CoA carboxylase  49.52 
 
 		 531 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  47.18 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  49.44 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>