More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2435 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.77 
 
 		 538 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  63.82 
 
 		 551 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.77 
 
 		 538 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  85.74 
 
 		 538 aa  960    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  63.52 
 
 		 539 aa  701    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  64.63 
 
 		 538 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 540 aa  1102    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  94.62 
 
 		 540 aa  1033    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  87.22 
 
 		 538 aa  974    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  94.99 
 
 		 540 aa  1036    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  64.38 
 
 		 539 aa  687    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  63.33 
 
 		 539 aa  706    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.96 
 
 		 538 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  61.78 
 
 		 537 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  72.41 
 
 		 536 aa  795    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  63.29 
 
 		 538 aa  618  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  58.15 
 
 		 553 aa  588  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  53.33 
 
 		 538 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  52.32 
 
 		 538 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  52.32 
 
 		 538 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  51.85 
 
 		 538 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  52.32 
 
 		 538 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  51.39 
 
 		 536 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  48.42 
 
 		 537 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  49.33 
 
 		 530 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  49.33 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.62 
 
 		 527 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  49.33 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  48.11 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  49.14 
 
 		 533 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  46.65 
 
 		 530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  47.7 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.96 
 
 		 532 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  49.8 
 
 		 542 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  47.33 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  45.4 
 
 		 532 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  47.82 
 
 		 528 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  45.97 
 
 		 536 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1031  Propionyl-CoA carboxylase  47.01 
 
 		 547 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.62 
 
 		 542 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.67 
 
 		 532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  45.49 
 
 		 534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  45.5 
 
 		 536 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  46.95 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  46.93 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  47.7 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  45.69 
 
 		 534 aa  452  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  44.87 
 
 		 554 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  47.73 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  46.74 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  46.08 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  45.12 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  46.29 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4552  propionyl-CoA carboxylase  46.42 
 
 		 534 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646598  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  46.15 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.79 
 
 		 535 aa  445  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  44.11 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  44.86 
 
 		 536 aa  443  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1712  Propionyl-CoA carboxylase  46.89 
 
 		 531 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.284858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  45.79 
 
 		 546 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  46.31 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  45.45 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  46.95 
 
 		 535 aa  445  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  45.23 
 
 		 535 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  45.52 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  45.85 
 
 		 540 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  46.31 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  45.58 
 
 		 552 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  45.06 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  46.62 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  45.32 
 
 		 554 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  46.31 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  46.29 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  45.61 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  45.61 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  45.59 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  45.8 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  45.71 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  46.23 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  44.55 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4160  propionyl-CoA carboxylase  44.76 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  46.15 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  46.1 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  44.49 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.24 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1857  propionyl-CoA carboxylase  47.1 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  45.71 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0930  carboxyl transferase  46.48 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0422748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  45.61 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  45.8 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  45.99 
 
 		 535 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  45.61 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  45.94 
 
 		 535 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>