More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1031 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1031  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 547 aa  1092    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  57.64 
 
 		 528 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  57.83 
 
 		 533 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  57.27 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  54.7 
 
 		 532 aa  594  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  57.52 
 
 		 527 aa  591  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  55.47 
 
 		 542 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  55.06 
 
 		 532 aa  585  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  54.88 
 
 		 530 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  54.7 
 
 		 530 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  54.64 
 
 		 549 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  54.7 
 
 		 530 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1712  Propionyl-CoA carboxylase  57.19 
 
 		 531 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.284858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  55.7 
 
 		 532 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  54.23 
 
 		 529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  54.68 
 
 		 530 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0346  carboxyl transferase  54.6 
 
 		 532 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4613  carboxyl transferase  55.03 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.898276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  50.71 
 
 		 554 aa  548  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3201  carboxyl transferase  54.84 
 
 		 533 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3263  carboxyl transferase  54.84 
 
 		 533 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4552  propionyl-CoA carboxylase  51.92 
 
 		 534 aa  545  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2828  carboxyl transferase  52.27 
 
 		 529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  49.54 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  48.91 
 
 		 540 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  48.45 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  47.91 
 
 		 535 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  47.45 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  50.45 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  47.18 
 
 		 536 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  47.91 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  47.91 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  46.2 
 
 		 554 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  48.18 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  48 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  47.72 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  47.72 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  47.72 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  48.45 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  46.99 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  47.18 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  47.72 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  47.82 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  47.72 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  46.45 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  46.45 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  47.18 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  49.82 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  47.18 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  49.45 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  48.26 
 
 		 541 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  47.45 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  49.73 
 
 		 535 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  48.32 
 
 		 536 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  46.08 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  46.81 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  46.63 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  47.99 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  47.99 
 
 		 535 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.84 
 
 		 541 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  46.85 
 
 		 540 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  46.27 
 
 		 535 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  47.83 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  46.42 
 
 		 535 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  47.81 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  46.99 
 
 		 535 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  47.81 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  46.45 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  46.08 
 
 		 538 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  46.63 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  47.58 
 
 		 537 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.99 
 
 		 535 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  45.9 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  46.21 
 
 		 540 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  46.55 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  48.57 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  46.07 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  47.46 
 
 		 535 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  46.83 
 
 		 540 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  46.79 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  47.64 
 
 		 535 aa  475  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  47.2 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.21 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  45.8 
 
 		 536 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  46.45 
 
 		 534 aa  475  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  47.4 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  45.17 
 
 		 535 aa  475  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  46.93 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.82 
 
 		 529 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.64 
 
 		 534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  45.82 
 
 		 546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  47.99 
 
 		 535 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  46.27 
 
 		 538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  46.65 
 
 		 540 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0737  propionyl-CoA carboxylase  46.46 
 
 		 534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  45.82 
 
 		 535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  46.7 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  46.7 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  44.99 
 
 		 536 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>