More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0675 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.38 
 
 		 538 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  73.61 
 
 		 536 aa  814    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  64.5 
 
 		 551 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  100 
 
 		 538 aa  1102    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.57 
 
 		 538 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  85.74 
 
 		 540 aa  941    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.75 
 
 		 538 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  85.16 
 
 		 540 aa  935    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  88.1 
 
 		 538 aa  990    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  85.34 
 
 		 540 aa  939    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  65.74 
 
 		 539 aa  708    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  63.57 
 
 		 538 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  64.07 
 
 		 539 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  63.89 
 
 		 539 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  62.57 
 
 		 537 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  64.97 
 
 		 538 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  58.81 
 
 		 553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  54.17 
 
 		 538 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  53.62 
 
 		 538 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  53.89 
 
 		 538 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  52.88 
 
 		 538 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  52.51 
 
 		 536 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  51.48 
 
 		 538 aa  537  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  47.31 
 
 		 537 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.81 
 
 		 527 aa  485  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  47.74 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  48.57 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  50 
 
 		 542 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  49.7 
 
 		 530 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  49.7 
 
 		 530 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  49.7 
 
 		 530 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  46.73 
 
 		 529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  47.94 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  46.21 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.4 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  45.08 
 
 		 534 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  44.78 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  45.1 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.72 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  46.3 
 
 		 535 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  46.42 
 
 		 535 aa  465  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  47.65 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  46.31 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  46.36 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  45.87 
 
 		 530 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  46.36 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  44.9 
 
 		 534 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  46.36 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  44.38 
 
 		 536 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  45.51 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  47.68 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.86 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  45.95 
 
 		 535 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  46.34 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  46.71 
 
 		 535 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  46.24 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  46.17 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  45.98 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  45.98 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  45.79 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  47.87 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  47.48 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  46.17 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  45.59 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  44.49 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  46.08 
 
 		 540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.92 
 
 		 532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  45.04 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3832  propionyl-CoA carboxylase  45.45 
 
 		 540 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  45.44 
 
 		 534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  44.65 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  44.87 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  45.11 
 
 		 553 aa  452  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  44.28 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1031  Propionyl-CoA carboxylase  45.34 
 
 		 547 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  45.83 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  44.91 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4160  propionyl-CoA carboxylase  45.03 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  45.95 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  45.45 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  43.73 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  45.45 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  45.02 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  45.27 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  45.27 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  45.45 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  44.73 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  45.27 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  45.45 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  45.27 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  45.45 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  44.46 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  45.27 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  45.27 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  45.27 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05479  propionyl-CoA carboxylase subunit beta  45.11 
 
 		 534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  45.45 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  45.21 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>