More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2413 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  62.08 
 
 		 539 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  62.57 
 
 		 538 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  74.4 
 
 		 551 aa  816    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  61.27 
 
 		 538 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 537 aa  1090    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  61.04 
 
 		 540 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  61.27 
 
 		 538 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  61.08 
 
 		 538 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  61.78 
 
 		 540 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  74.17 
 
 		 539 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  61.27 
 
 		 538 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  62.08 
 
 		 539 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  61.78 
 
 		 540 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  62.78 
 
 		 553 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  60.07 
 
 		 536 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  61.45 
 
 		 538 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  61.26 
 
 		 538 aa  578  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  52.22 
 
 		 538 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  51.96 
 
 		 536 aa  538  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  52.41 
 
 		 538 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  52.59 
 
 		 538 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  52.22 
 
 		 538 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  51.48 
 
 		 538 aa  518  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.51 
 
 		 527 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  46.42 
 
 		 535 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  45.77 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  48.43 
 
 		 533 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  46.32 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  47.03 
 
 		 529 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  46.11 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  45.59 
 
 		 535 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  45.32 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  48.55 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.42 
 
 		 528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.69 
 
 		 532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  47.78 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  49.69 
 
 		 530 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  45.67 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  44.67 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  45.49 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  47.39 
 
 		 542 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  49.49 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  44.4 
 
 		 530 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1031  Propionyl-CoA carboxylase  46.37 
 
 		 547 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  49.49 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.51 
 
 		 534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  43.67 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4613  carboxyl transferase  48.31 
 
 		 539 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.898276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  44.04 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  47.5 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  43.46 
 
 		 554 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  43.81 
 
 		 536 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  44.97 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  45.49 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  43.09 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  43.49 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  41.73 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  43.99 
 
 		 536 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  43.93 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  45.19 
 
 		 554 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  43.75 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  45.5 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  43.75 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  43.49 
 
 		 535 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 541 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  44.42 
 
 		 535 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  45.22 
 
 		 535 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  45.72 
 
 		 535 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  43.59 
 
 		 552 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  43.8 
 
 		 535 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  43.81 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  45.32 
 
 		 535 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  44.24 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  45.64 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  44.49 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  45.64 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  43.93 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  45.82 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  45.64 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  44.14 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  43.93 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  45.82 
 
 		 535 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  43.93 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  44.18 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  44.94 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  45.82 
 
 		 535 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  45.42 
 
 		 533 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  44.18 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  44.12 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  43.49 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  44.12 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  44.2 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  45.64 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  43.93 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  44.42 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  42.1 
 
 		 535 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  42.75 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  43.85 
 
 		 535 aa  432  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  42.33 
 
 		 536 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3263  carboxyl transferase  48.41 
 
 		 533 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>