More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4463 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0106  carboxyl transferase  64.31 
 
 		 539 aa  695    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2435  Propionyl-CoA carboxylase  63.82 
 
 		 540 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0113  carboxyl transferase  64.5 
 
 		 539 aa  693    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4463  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 551 aa  1122    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1149  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  62.29 
 
 		 538 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0289  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  62.64 
 
 		 538 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3260  propionyl-CoA carboxylase  63.65 
 
 		 540 aa  675    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.395839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2413  propionyl-CoA carboxylase  74.4 
 
 		 537 aa  816    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.193617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3201  propionyl-CoA carboxylase  64.13 
 
 		 538 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0349643  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4183  propionyl-CoA carboxylase  61.85 
 
 		 553 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2774  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  62.29 
 
 		 538 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0327  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  63.4 
 
 		 536 aa  680    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2204  propionyl-CoA carboxylase  64.07 
 
 		 540 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.354632  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1721  carboxyl transferase  88.87 
 
 		 539 aa  963    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2929  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  62.8 
 
 		 538 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0675  putative carboxylase  64.5 
 
 		 538 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1897  propionyl-CoA carboxylase  63.49 
 
 		 538 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2804  propionyl-CoA carboxylase  54.44 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2818  propionyl-CoA carboxylase  53.43 
 
 		 536 aa  561  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0599136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2691  propionyl-CoA carboxylase  53.45 
 
 		 538 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165728  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3947  carboxyl transferase  52.59 
 
 		 538 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26720  putative biotin-dependent carboxylase  52.22 
 
 		 538 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2266  putative biotin-dependent carboxylase  52.41 
 
 		 538 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0317  carboxyl transferase  47.96 
 
 		 537 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2067  propionyl-CoA carboxylase  46.58 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  47.87 
 
 		 529 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  48.89 
 
 		 533 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  49.25 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  46.58 
 
 		 536 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  48.52 
 
 		 533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  45.5 
 
 		 554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  46.4 
 
 		 536 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  48.89 
 
 		 528 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  45.14 
 
 		 535 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  49.5 
 
 		 554 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.07 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  45.77 
 
 		 535 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  48.77 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1031  Propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 		 547 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  48.14 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  46.7 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  46.78 
 
 		 540 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  45.2 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  46.68 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4722  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  46.46 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  46.22 
 
 		 534 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.26 
 
 		 532 aa  458  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  47.33 
 
 		 534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  46.41 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  45.12 
 
 		 535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  46.59 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  47.97 
 
 		 534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  46.72 
 
 		 530 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  46.59 
 
 		 535 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  45.89 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  45.87 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  46.59 
 
 		 535 aa  452  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  45.32 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  45.39 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  46.59 
 
 		 535 aa  452  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  46.59 
 
 		 535 aa  452  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  46.59 
 
 		 535 aa  452  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  46.96 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4377  Propionyl-CoA carboxylase  46.22 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  47.03 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  45.57 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  45.32 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  45.27 
 
 		 547 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  46.59 
 
 		 535 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  46.7 
 
 		 540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  45.77 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  45.22 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  45.1 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  45.7 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  45.67 
 
 		 536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  46.84 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  45.77 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  46.84 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  45.8 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1734  propionyl-CoA carboxylase  46.42 
 
 		 535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0659014  normal  0.584019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  44.26 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  45.77 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  44.22 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  43.07 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  44.04 
 
 		 535 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0471  propionyl-CoA carboxylase  45.14 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  47.06 
 
 		 536 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  44.04 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  44.04 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  43.85 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  44.04 
 
 		 535 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  43.85 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>