More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0163 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0163  carboxyl transferase  100 
 
 
530 aa  1065    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000870722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5055  carboxyl transferase  57.22 
 
 
554 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3230  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  61.47 
 
 
532 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00712418  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4433  Propionyl-CoA carboxylase  59.85 
 
 
532 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0300749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  60.34 
 
 
527 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3829  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  58.65 
 
 
532 aa  633  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.507183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4686  propionyl-CoA carboxylase  59.43 
 
 
530 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4392  propionyl-CoA carboxylase  59.25 
 
 
530 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64997  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4306  propionyl-CoA carboxylase  59.25 
 
 
530 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10992  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD2  59.13 
 
 
529 aa  621  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20436  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1712  Propionyl-CoA carboxylase  59.63 
 
 
531 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4767  carboxyl transferase  60.26 
 
 
533 aa  621  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.339159  decreased coverage  0.0000347279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4327  propionyl-CoA carboxylase  59.89 
 
 
533 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0134236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1883  propionyl-CoA carboxylase  59.88 
 
 
542 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314426  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0346  carboxyl transferase  56.77 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.705455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4848  propionyl-CoA carboxylase  57.97 
 
 
549 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789174  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4552  propionyl-CoA carboxylase  58.57 
 
 
534 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16510  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  60.81 
 
 
528 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4613  carboxyl transferase  58.19 
 
 
539 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.898276  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3263  carboxyl transferase  58.19 
 
 
533 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81702  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3201  carboxyl transferase  58.19 
 
 
533 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2828  carboxyl transferase  55.45 
 
 
529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1031  Propionyl-CoA carboxylase  54.5 
 
 
547 aa  551  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  50.84 
 
 
554 aa  547  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  51.58 
 
 
535 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  50.84 
 
 
535 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  51.58 
 
 
535 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  51.77 
 
 
535 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  51.21 
 
 
535 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  50.47 
 
 
535 aa  541  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  50.75 
 
 
535 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_004310  BR0019  carboxyl transferase family protein  52.7 
 
 
535 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  50.75 
 
 
535 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  51.02 
 
 
535 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0016  carboxyl transferase family protein  52.42 
 
 
535 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0038  propionyl-CoA carboxylase  52.14 
 
 
535 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  52.05 
 
 
535 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  52.05 
 
 
535 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 
535 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  49.91 
 
 
535 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49550  Acyl-CoA carboxylase  51.49 
 
 
535 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461683  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0092  carboxyl transferase  49.72 
 
 
535 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.684642  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0609  carboxyl transferase  48.98 
 
 
535 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0584706  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4533  propionyl-CoA carboxylase  50.47 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  48.42 
 
 
546 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  50.46 
 
 
535 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2118  propionyl-CoA carboxylase  49.45 
 
 
540 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2926  propionyl-CoA carboxylase  47.86 
 
 
535 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  48.23 
 
 
535 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  49.91 
 
 
535 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  48.04 
 
 
535 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  50.37 
 
 
536 aa  508  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0128  Propionyl-CoA carboxylase  48.42 
 
 
535 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.818447  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  50.09 
 
 
535 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1643  propionyl-CoA carboxylase  50.74 
 
 
537 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552875  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  47.49 
 
 
535 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0269  putative propionyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  48.6 
 
 
535 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  47.3 
 
 
535 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  49.63 
 
 
536 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  47.58 
 
 
535 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  48.04 
 
 
535 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3359  propionyl-CoA carboxylase  48.71 
 
 
540 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0120  Propionyl-CoA carboxylase  48.23 
 
 
535 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1791  hypothetical protein  47.77 
 
 
535 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4377  Propionyl-CoA carboxylase  49.16 
 
 
536 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  48.52 
 
 
535 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  48.88 
 
 
534 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  47.11 
 
 
535 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0737  propionyl-CoA carboxylase  50.19 
 
 
534 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138486  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  48.98 
 
 
536 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  47.31 
 
 
534 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1875  propionyl-CoA carboxylase  49.17 
 
 
538 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5973  propionyl-CoA carboxylase  48.42 
 
 
535 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5120  propionyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 
535 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0213028  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  48.6 
 
 
535 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  48.22 
 
 
534 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  48.03 
 
 
547 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  46.64 
 
 
536 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  47.11 
 
 
535 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0309  putative acyl-CoA carboxylase (beta subunit) protein  46.83 
 
 
536 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155746  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1605  carboxyl transferase  48.78 
 
 
534 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.811146  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0424  propionyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 
535 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2571  propionyl-CoA carboxylase  46.37 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2934  propionyl-CoA carboxylase  48.59 
 
 
534 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.126477  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 
535 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2786  propionyl-CoA carboxylase  48.04 
 
 
538 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.368132 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  48.98 
 
 
535 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  47.19 
 
 
552 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1361  propionyl-CoA carboxylase  46.74 
 
 
535 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  49.72 
 
 
535 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000378  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  45.34 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.723902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  47.3 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  47.59 
 
 
535 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  47.59 
 
 
535 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  46.74 
 
 
535 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  47.78 
 
 
535 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 
535 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  47.65 
 
 
535 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  46.55 
 
 
535 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.562625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>