More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1991 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  89.58 
 
 		 240 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  89.17 
 
 		 240 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  89.12 
 
 		 240 aa  437  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  89.17 
 
 		 240 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  89.74 
 
 		 236 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  86.67 
 
 		 240 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  87.5 
 
 		 240 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  86.75 
 
 		 236 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  84.19 
 
 		 236 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  83.33 
 
 		 236 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  78.63 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  78.63 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  77.78 
 
 		 236 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  77.31 
 
 		 258 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  77.78 
 
 		 236 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  77.68 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  78.97 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  73.95 
 
 		 238 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  74.25 
 
 		 238 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  73.73 
 
 		 238 aa  358  4e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  75.64 
 
 		 237 aa  353  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  72.65 
 
 		 236 aa  351  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  72.65 
 
 		 236 aa  350  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  62.29 
 
 		 241 aa  308  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  62.29 
 
 		 241 aa  308  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  58.23 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  58.23 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  59.32 
 
 		 242 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  57.26 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  57.56 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  59.4 
 
 		 249 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.81 
 
 		 251 aa  291  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.08 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  59.31 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  59.83 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.33 
 
 		 238 aa  288  6e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  58.37 
 
 		 246 aa  288  7e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  58.01 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  58.37 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  55.98 
 
 		 245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  57.51 
 
 		 239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  56.65 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  56.03 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  57.94 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  56.71 
 
 		 235 aa  281  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  57.69 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  57.58 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  57.69 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  55.08 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  57.87 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  55.74 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  55.41 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  55.41 
 
 		 235 aa  278  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  58.55 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  58.05 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  56.3 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  56.6 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  57.26 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  56.3 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  57.02 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  55.74 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  56.6 
 
 		 241 aa  274  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  56.41 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  58.01 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  58.01 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  55.13 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  56.72 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  56.41 
 
 		 247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  56.17 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>