More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1628 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 		 305 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  69.08 
 
 		 300 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  66.67 
 
 		 300 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  66.67 
 
 		 300 aa  424  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  64.8 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  62.83 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  63.96 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  60.73 
 
 		 301 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  63.11 
 
 		 304 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  57.89 
 
 		 304 aa  362  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  56.07 
 
 		 306 aa  350  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  46.53 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  46.2 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  46.36 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  47.35 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  47.52 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  41.58 
 
 		 307 aa  225  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  38.51 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  40.2 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  36.63 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.81 
 
 		 237 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  32.77 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  32.94 
 
 		 269 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  30.13 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  31.4 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  31.69 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  34.3 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  31.28 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  32.5 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.56 
 
 		 470 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  31.28 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  30.86 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  32.76 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  35.25 
 
 		 252 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  30.86 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  30.86 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  30.86 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  30.86 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  31.28 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  30.86 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  35.22 
 
 		 425 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  31.54 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  32.77 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  32.7 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  30.99 
 
 		 257 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  33.86 
 
 		 238 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  33.91 
 
 		 449 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 		 236 aa  99  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3377  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.67 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  decreased coverage  0.000190806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  28.74 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  34.32 
 
 		 477 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  35.93 
 
 		 466 aa  97.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 		 259 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  31.82 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  32.25 
 
 		 386 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 		 256 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  30.86 
 
 		 445 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.75 
 
 		 276 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  32.64 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  33.33 
 
 		 469 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  34.8 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  34.35 
 
 		 244 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  31.71 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.83 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  29.83 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  29.67 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.52 
 
 		 597 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  33.04 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  31.85 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  32.3 
 
 		 538 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.64 
 
 		 517 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  37.02 
 
 		 234 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  31.76 
 
 		 256 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  32.1 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.96 
 
 		 247 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  34.04 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.95 
 
 		 238 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  30.64 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  35.62 
 
 		 234 aa  92.4  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  30.45 
 
 		 256 aa  92.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  31.25 
 
 		 394 aa  92.4  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.18 
 
 		 516 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 		 467 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.45 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  32.31 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.45 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0002  protein serine/threonine phosphatase  30.68 
 
 		 617 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.818409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  34.6 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  29.17 
 
 		 253 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  30.04 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  29.28 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  27.73 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>