57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6383 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6383  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1172  putative DNA-binding protein H-NS  94.32 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6348  hypothetical protein  85.39 
 
 		 83 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00180642  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5064  hypothetical protein  56.47 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02370  hypothetical protein  54.88 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14298  normal  0.0406002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4462  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168905  normal  0.0423453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3959  hypothetical protein  49.48 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0572114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1142  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50.59 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4404  hypothetical protein  53.01 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4294  hypothetical protein  53.01 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3930  hypothetical protein  37.04 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2777  hypothetical protein  39.51 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000199644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3892  hypothetical protein  40.24 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1018  hypothetical protein  36.14 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697598  normal  0.0957494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5701  hypothetical protein  36.14 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6763  hypothetical protein  34.57 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430903  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  36.05 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6773  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.94 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00017117  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2592  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.73 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1064  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.94 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  33.33 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4587  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.53 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918729 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  36.14 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.95 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4222  hypothetical protein  33.73 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.72 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.72 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.52 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3237  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.49 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.71 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2172  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5080  Ler  34.94 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0343561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.82 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.94 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.4 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.93 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.93 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.49 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.71 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2848  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.27 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000899352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2996  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.27 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.18601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.07 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2867  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.27 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00308675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1510  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.27 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000161891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  29.27 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112117  normal  0.570223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2749  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.09 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000604606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.79 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0515948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6195  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170725  normal  0.0606924 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.06 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2540  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.05 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000233995  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.47 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  25.88 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1168  H-NS family DNA-binding protein  35.37 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.56 
 
 		 114 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>