79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5110 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  69.08 
 
 
653 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  62.91 
 
 
630 aa  796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  70.18 
 
 
651 aa  907    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  61.82 
 
 
678 aa  818    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  69.49 
 
 
678 aa  913    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  68.42 
 
 
650 aa  901    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  68.02 
 
 
652 aa  891    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  68.17 
 
 
653 aa  858    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  69.08 
 
 
653 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  69.38 
 
 
653 aa  878    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  69.49 
 
 
678 aa  913    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  69.38 
 
 
653 aa  878    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  64.44 
 
 
662 aa  818    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  68.42 
 
 
650 aa  899    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  55.32 
 
 
648 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  70.59 
 
 
653 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  68.33 
 
 
651 aa  907    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  68.78 
 
 
654 aa  908    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  56.64 
 
 
688 aa  710    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  62.9 
 
 
631 aa  802    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  69.38 
 
 
653 aa  878    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  69.64 
 
 
654 aa  912    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  100 
 
 
673 aa  1386    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  69.34 
 
 
653 aa  900    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  69.08 
 
 
653 aa  875    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  68.39 
 
 
650 aa  897    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  42.88 
 
 
623 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7168  putative exported alkaline phosphatase  74.17 
 
 
253 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  33.72 
 
 
583 aa  276  7e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  32.04 
 
 
607 aa  231  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  34.86 
 
 
630 aa  217  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  35.71 
 
 
625 aa  213  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  29.72 
 
 
631 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  27.48 
 
 
626 aa  131  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  29 
 
 
624 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  29.33 
 
 
612 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  35.83 
 
 
887 aa  68.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  22.86 
 
 
699 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  27.41 
 
 
883 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  23.39 
 
 
699 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  23.39 
 
 
699 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  27.6 
 
 
884 aa  61.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  23.17 
 
 
695 aa  58.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  25.34 
 
 
662 aa  55.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  24.2 
 
 
680 aa  53.9  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  25 
 
 
593 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  28.21 
 
 
632 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  25 
 
 
593 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  21.66 
 
 
593 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  25.46 
 
 
638 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
596 aa  51.2  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  29.65 
 
 
587 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  28.85 
 
 
638 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  27.94 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  25.63 
 
 
672 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  26.67 
 
 
458 aa  48.9  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
639 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  26.05 
 
 
672 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  23.82 
 
 
681 aa  48.5  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  23.53 
 
 
651 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  27.53 
 
 
629 aa  48.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  26.42 
 
 
663 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  28.11 
 
 
689 aa  47.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  26.34 
 
 
726 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  27.46 
 
 
674 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  26.67 
 
 
383 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
633 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  23.53 
 
 
560 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  28.63 
 
 
698 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  23.54 
 
 
659 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  23.75 
 
 
659 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  26.48 
 
 
677 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  25.37 
 
 
736 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  28.8 
 
 
821 aa  45.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  27.38 
 
 
691 aa  45.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  26.22 
 
 
669 aa  44.3  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 
627 aa  44.3  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  26.96 
 
 
383 aa  44.3  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0732  protein of unknown function DUF839  26.04 
 
 
642 aa  44.3  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>