62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4816 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.16 
 
 		 261 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.16 
 
 		 261 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  78.93 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  77.39 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.01 
 
 		 261 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  78.93 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  78.54 
 
 		 261 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  76.25 
 
 		 261 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  72.41 
 
 		 259 aa  361  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  75.86 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  75.86 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  75.86 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  73.56 
 
 		 261 aa  345  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  75.1 
 
 		 261 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  75.1 
 
 		 261 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  75.1 
 
 		 261 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  75.1 
 
 		 261 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.7 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  69.11 
 
 		 258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.29 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  39.22 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.02 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.86 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.9 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.25 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  37.25 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.86 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  36.86 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.43 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  37.8 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  37.4 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.71 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  33.07 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.2 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.88 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.33 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.46 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.64 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.75 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.19 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.26 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.21 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.71 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1823  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.93 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0520977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1474  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.78 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  30.19 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.61 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.13 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.11 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2087  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  25.13 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.859771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.19 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1359  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.17 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  31.21 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  32 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  32.04 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.4 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.11 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.43 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.38 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4026  electron transfer flavoprotein  28.12 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.27 
 
 		 256 aa  42  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>