54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0492 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0492  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71310  hypothetical protein  85.99 
 
 		 257 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6188  hypothetical protein  85.21 
 
 		 257 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0336  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  78.66 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0334  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  78.26 
 
 		 256 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507575  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4894  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  77.47 
 
 		 256 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124333  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0313  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative  77.87 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000451759  hitchhiker  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5220  electron transfer flavoprotein subunit beta  77.08 
 
 		 256 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456604  hitchhiker  0.00238427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0399  electron transfer flavoprotein, beta subunit  72.55 
 
 		 265 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4779  electron transfer flavoprotein, beta subunit  73.62 
 
 		 265 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.378484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0993  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.53 
 
 		 267 aa  298  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2721  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.81 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.768779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4014  hypothetical protein  56.49 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3297  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.29 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25112  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0061  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.19 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3401  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.46 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5206  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.85 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3289  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.45 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5079  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.45 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3552  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.01 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5016  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.61 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  normal  0.568538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4491  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.61 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0577  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.83 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5069  putative electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.35 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  hitchhiker  0.00306508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4816  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.43 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239408  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0834  putative electron transfer flavoprotein subunit  34.12 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0746  putative electron transfer flavoprotein subunit  34.12 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2113  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.12 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1862  hypothetical protein  34.9 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763652  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1579  putative electron transfer flavoprotein beta- subunit  35.55 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1973  hypothetical protein  33.73 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0477  hypothetical protein  33.73 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1000  hypothetical protein  33.73 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0704  hypothetical protein  33.73 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.38 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4038  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.14 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.383173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3998  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.75 
 
 		 263 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3743  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.38 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.167959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4056  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.52 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0997  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.2 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4274  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  23.53 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0918  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.42 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02578  hypothetical protein  28.42 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2899  electron transfer flavoprotein  29.58 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.42 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3072  electron transfer flavoprotein  28.42 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.739339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02615  predicted flavoprotein  28.42 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2910  electron transfer flavoprotein  28.95 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.05 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3103  electron transfer flavoprotein  27.89 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000649113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  35.86 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0462  electron transfer flavoprotein, beta-subunit  29.86 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4026  electron transfer flavoprotein  27.37 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.69 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>