More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0106 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
266 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.7 
 
 
260 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.08 
 
 
257 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  44.06 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40 
 
 
259 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.02 
 
 
257 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.86 
 
 
258 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.05 
 
 
257 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0048  electron transfer flavoprotein subunit beta  40.64 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0052  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.64 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.47 
 
 
260 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.91 
 
 
259 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1074  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.22 
 
 
280 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250999  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  39.83 
 
 
259 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  41.56 
 
 
259 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0064  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.28 
 
 
267 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.2 
 
 
257 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  41.2 
 
 
257 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  41.2 
 
 
257 aa  168  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  41.2 
 
 
257 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.2 
 
 
257 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.2 
 
 
257 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  41.2 
 
 
257 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  40.4 
 
 
261 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.82 
 
 
257 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  40.82 
 
 
257 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  40.82 
 
 
257 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.88 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4258  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  40.82 
 
 
257 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.3 
 
 
259 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.81 
 
 
446 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3659  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.54 
 
 
261 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.34 
 
 
259 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.59 
 
 
259 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.87 
 
 
267 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.87 
 
 
259 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.7 
 
 
255 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6581  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.59 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.5 
 
 
250 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.58 
 
 
286 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.17 
 
 
260 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4640  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.74 
 
 
263 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1485  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.25 
 
 
262 aa  150  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0507333  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.47 
 
 
277 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.12 
 
 
250 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  40.15 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.06 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3697  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.85 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.61 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.96 
 
 
260 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.36 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.31 
 
 
253 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.84 
 
 
249 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  37.7 
 
 
259 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0049  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.65 
 
 
267 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.523464 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1193  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.31 
 
 
285 aa  143  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.40527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.97 
 
 
256 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.69 
 
 
249 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  36.4 
 
 
261 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1698  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.29 
 
 
255 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.214951  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10278  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07300)  35.29 
 
 
261 aa  142  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19095  normal  0.236611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.69 
 
 
249 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.59 
 
 
249 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1495  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.09 
 
 
249 aa  142  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.94 
 
 
251 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.2 
 
 
249 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.08 
 
 
249 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.36 
 
 
249 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.84 
 
 
249 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.5 
 
 
249 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.83 
 
 
249 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.98 
 
 
249 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.89 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.88 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1262  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  36.57 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.74 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.43 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3160  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.09 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.98 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.76 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.76 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.92 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.92 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.84 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.18 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.18 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.76 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.6 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0763  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.96 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.944822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0953  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.36 
 
 
249 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2917  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.51 
 
 
261 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0846128  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0719  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.71 
 
 
253 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.02869  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.34 
 
 
252 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.21 
 
 
258 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.5 
 
 
249 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.5 
 
 
249 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.36 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02100  mitochondrion protein, putative  36.9 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.23 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.4 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>