More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6581 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6581  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.54 
 
 
249 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.26 
 
 
249 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.49 
 
 
253 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  45.49 
 
 
253 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.53 
 
 
249 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.89 
 
 
249 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.53 
 
 
249 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.16 
 
 
249 aa  205  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  47.57 
 
 
248 aa  205  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  47.57 
 
 
248 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  44.16 
 
 
249 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  44.16 
 
 
249 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  44.16 
 
 
250 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  44.53 
 
 
249 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  44.53 
 
 
249 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.89 
 
 
249 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.65 
 
 
252 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.13 
 
 
253 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  46.35 
 
 
249 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.53 
 
 
249 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.34 
 
 
250 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.26 
 
 
249 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  46.82 
 
 
248 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.43 
 
 
271 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.53 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.26 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0048  electron transfer flavoprotein subunit beta  44.29 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.26 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.26 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.26 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0064  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.29 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.26 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.62 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  43.07 
 
 
249 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  43.8 
 
 
249 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2847  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000762035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.07 
 
 
249 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.99 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1511  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178615  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  43.8 
 
 
249 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2866  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000232207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2995  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0119952  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0052  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.94 
 
 
267 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.99 
 
 
249 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.16 
 
 
249 aa  198  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.62 
 
 
249 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.62 
 
 
249 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.62 
 
 
249 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  44.89 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.89 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.89 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  45.26 
 
 
249 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  45.99 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.12 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.53 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.61 
 
 
249 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.89 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.4 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.62 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.26 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.07 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.89 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.62 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.43 
 
 
446 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.16 
 
 
249 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  47.81 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.16 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.32 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3160  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.34 
 
 
249 aa  195  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.89 
 
 
249 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  43.8 
 
 
249 aa  195  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.8 
 
 
249 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.8 
 
 
249 aa  194  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  44.89 
 
 
249 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.07 
 
 
249 aa  194  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  43.8 
 
 
249 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0953  electron transfer flavoprotein subunit beta  43.8 
 
 
249 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.43 
 
 
256 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.53 
 
 
249 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.53 
 
 
249 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  43.43 
 
 
249 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.16 
 
 
249 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  43.8 
 
 
249 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  45.62 
 
 
249 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3561  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.08 
 
 
249 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.528846  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44.16 
 
 
249 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4915  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.81 
 
 
249 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751979  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.53 
 
 
249 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>