More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0064 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0064  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  100 
 
 
267 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0048  electron transfer flavoprotein subunit beta  98.5 
 
 
267 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0052  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  98.13 
 
 
267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0049  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  89.14 
 
 
267 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.523464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  82.02 
 
 
267 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.02 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.02 
 
 
249 aa  272  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  55.6 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.64 
 
 
249 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.89 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.26 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  54.89 
 
 
249 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  54.14 
 
 
249 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.14 
 
 
249 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.14 
 
 
249 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.26 
 
 
249 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.14 
 
 
249 aa  261  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.26 
 
 
249 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.51 
 
 
249 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.51 
 
 
249 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.14 
 
 
249 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.76 
 
 
249 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.01 
 
 
249 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.89 
 
 
249 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.51 
 
 
249 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
250 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.36 
 
 
251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  53.38 
 
 
249 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.49 
 
 
249 aa  258  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  54.14 
 
 
249 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.14 
 
 
249 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.51 
 
 
249 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.89 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.14 
 
 
249 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.76 
 
 
249 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.01 
 
 
249 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.76 
 
 
249 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.38 
 
 
249 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.76 
 
 
249 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.76 
 
 
249 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.76 
 
 
249 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.76 
 
 
249 aa  254  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  53.76 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  53.76 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.14 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  53.76 
 
 
249 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.88 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  53.38 
 
 
249 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  53.08 
 
 
249 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2146  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.63 
 
 
271 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0676192  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.38 
 
 
249 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.88 
 
 
249 aa  251  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  51.13 
 
 
249 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.88 
 
 
249 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.26 
 
 
249 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.5 
 
 
249 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.5 
 
 
249 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.51 
 
 
249 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.63 
 
 
249 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.13 
 
 
249 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.13 
 
 
249 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.88 
 
 
249 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.13 
 
 
256 aa  248  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.01 
 
 
249 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.88 
 
 
249 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  52.26 
 
 
249 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.62 
 
 
249 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.47 
 
 
253 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.38 
 
 
249 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1752  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.14 
 
 
249 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0841122 
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.69 
 
 
248 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50 
 
 
249 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.26 
 
 
249 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  52.69 
 
 
248 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.38 
 
 
249 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0502  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.9 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138383  normal  0.0771206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  51.5 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000407  electron transfer flavoprotein beta subunit  50.38 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.69 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  51.88 
 
 
249 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0984  electron transfer flavoprotein subunit beta  49.62 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.26 
 
 
249 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.13 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.62 
 
 
249 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2532  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.51 
 
 
249 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.944652  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.62 
 
 
249 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.26 
 
 
249 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.13 
 
 
249 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  50 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  51.13 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  50 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  50 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.62 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>