More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02100 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02100  mitochondrion protein, putative  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.3 
 
 
249 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.38 
 
 
249 aa  284  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10278  electron transfer flavoprotein, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07300)  56.02 
 
 
261 aa  281  6.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19095  normal  0.236611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  60.62 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60 
 
 
249 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60 
 
 
249 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.85 
 
 
249 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.85 
 
 
249 aa  278  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  59.29 
 
 
251 aa  277  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  60.31 
 
 
249 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.85 
 
 
249 aa  275  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.08 
 
 
249 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.85 
 
 
252 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  58.59 
 
 
249 aa  274  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.98 
 
 
249 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.21 
 
 
249 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.85 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.98 
 
 
248 aa  271  9e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.98 
 
 
248 aa  271  9e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.3 
 
 
249 aa  271  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.53 
 
 
249 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.3 
 
 
249 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.92 
 
 
249 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.92 
 
 
249 aa  269  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.2 
 
 
248 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.92 
 
 
249 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.83 
 
 
249 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.92 
 
 
249 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.92 
 
 
249 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  56.98 
 
 
252 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.47 
 
 
253 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.98 
 
 
249 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.14 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.98 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.53 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.14 
 
 
249 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.73 
 
 
249 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.53 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  60.31 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.34 
 
 
249 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.14 
 
 
249 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.05 
 
 
249 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.21 
 
 
249 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.37 
 
 
249 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.53 
 
 
249 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.98 
 
 
249 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.14 
 
 
249 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.53 
 
 
249 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.92 
 
 
249 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.98 
 
 
249 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.2 
 
 
249 aa  262  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.76 
 
 
267 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.53 
 
 
249 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.6 
 
 
249 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0753  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.98 
 
 
251 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.98 
 
 
249 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.14 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.37 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.76 
 
 
249 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.37 
 
 
249 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.6 
 
 
249 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.98 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.98 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2532  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.3 
 
 
249 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.944652  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.81 
 
 
249 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  59.07 
 
 
249 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.98 
 
 
249 aa  259  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.98 
 
 
249 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.6 
 
 
249 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.38 
 
 
252 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.83 
 
 
249 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.94 
 
 
253 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.94 
 
 
253 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.6 
 
 
249 aa  258  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  54.44 
 
 
249 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.17 
 
 
253 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5519  electron transfer flavoprotein subunit beta  56.76 
 
 
249 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3854  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.37 
 
 
249 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445723  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3561  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.53 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.528846  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.09 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.09 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0250  electron transfer flavoprotein subunit beta EtfB  57.66 
 
 
249 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.47 
 
 
249 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.46 
 
 
249 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  53.64 
 
 
249 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.44 
 
 
249 aa  251  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4915  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.98 
 
 
249 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751979  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.05 
 
 
249 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  52.9 
 
 
249 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1998  ATPase  52.9 
 
 
249 aa  248  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00163986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>