More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0719 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0719  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
253 aa  503  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.02869  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0763  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.75 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.944822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.51 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2855  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.55 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2584  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.22 
 
 
249 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000331041  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.61 
 
 
249 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0456  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.28 
 
 
250 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3169  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.28 
 
 
250 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.6 
 
 
249 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.5 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000795792  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.15 
 
 
260 aa  164  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  44 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  43.52 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.72 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0986  electron transfer flavoprotein subunit beta  39.37 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0532  electron transport flavoprotein beta-subunit  37.07 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1006  electron transfer flavoprotein subunit beta  39.37 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0925  electron transfer flavoprotein subunit beta  39.37 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.55 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0957  electron transfer flavoprotein subunit beta  39.37 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0527  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.07 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240946  hitchhiker  0.00903597 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17860  predicted protein  38.08 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.587324  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2550  electron transfer flavoprotein beta-subunit  44.2 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321051  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0614  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  37.84 
 
 
249 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.347072  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2847  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.6 
 
 
249 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000762035  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.74 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2866  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.6 
 
 
249 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000232207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1511  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.6 
 
 
249 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178615  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2995  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.6 
 
 
249 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0119952  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3687  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.92 
 
 
250 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.519348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.81 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.5 
 
 
249 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7804  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.4 
 
 
446 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2511  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.6 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000144951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1352  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.21 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00189671  hitchhiker  0.00845091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1417  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.21 
 
 
249 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000497046  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000407  electron transfer flavoprotein beta subunit  36.47 
 
 
250 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.28 
 
 
249 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1405  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.82 
 
 
249 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000200993  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.5 
 
 
249 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  39.08 
 
 
253 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.19 
 
 
249 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3145  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.82 
 
 
249 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.58 
 
 
249 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1613  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.43 
 
 
250 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1495  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.47 
 
 
249 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6870  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.62 
 
 
249 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562162  normal  0.410167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.19 
 
 
249 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.93 
 
 
249 aa  158  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3160  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.61 
 
 
249 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1169  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.19 
 
 
249 aa  158  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000191925  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.55 
 
 
249 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  39.81 
 
 
249 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  38.98 
 
 
249 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.58 
 
 
249 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6309  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42.15 
 
 
249 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.58 
 
 
249 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  40.48 
 
 
249 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.58 
 
 
249 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.8 
 
 
249 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.8 
 
 
249 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.16 
 
 
249 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.35 
 
 
249 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2427  electron transfer flavoprotein beta-subunit  40.45 
 
 
252 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.13 
 
 
249 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  37.8 
 
 
249 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.8 
 
 
249 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42 
 
 
249 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1445  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.58 
 
 
249 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0968162  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.01 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.19 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  38.19 
 
 
249 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.19 
 
 
249 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  38.19 
 
 
249 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.91 
 
 
249 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.98 
 
 
249 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.21 
 
 
253 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.8 
 
 
249 aa  154  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.92 
 
 
253 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  42 
 
 
249 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  40.99 
 
 
252 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.92 
 
 
253 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.4 
 
 
249 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.61 
 
 
249 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.19 
 
 
249 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  37.4 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  39.81 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00996  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.58 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05548  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.97 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.58 
 
 
249 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.43 
 
 
249 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.58 
 
 
249 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.13 
 
 
249 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.4 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.43 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.94 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  38.19 
 
 
249 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.19 
 
 
249 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  40.39 
 
 
258 aa  151  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>